数学及其应用教育部重点实验室（北京大学）是作为世界银行贷款“重点学科发展项目”于1989年建立的。

1994年成为国家教委重点开放实验室，1995年通过了国家教委世界银行贷款项目专家组对实验室的验收检查；2000年被准予参加国家实验室评估，被评为国家A级重点实验室，名列当年数理口第三。2004年10月参加教育部重点实验室的评估，被评为优秀。2009年在教育部重点实验室的评估中，再次被评为优秀类实验室。

自实验室成立以来，在国家科技部、教育部和北京大学的领导和大力支持下，北京大学“数学及其应用”实验室根据世界数学发展潮流，瞄准国际一流目标，在科研体制改革、年轻数学家成长、前沿课题研究等方面都取得令人高兴的突出成绩，为在新世纪把实验室建设成为国际一流的数学研究中心奠定了坚实基础。

实验室现有全职研究人员53人，兼职研究人员3人，事务秘书1人。其中教授和博士导师40人，副教授10人，讲师3人，中科院院士6人，杰出青年基金(A类)获得者16人，973首席科学家1人，973课题负责人5人，973课题组成员18人，跨世纪人才基金获得者5人，国家基金委重点项目主持人4人，课题组成员10人。实验室设学术秘书1人。

实验室设有4个子实验室：计算实验室，金融实验室，信息安全实验室，图像处理实验室；两个研究中心：几何分析中心，信息技术研究与开发中心。

实验室下设11个研究组：几何分析，低维拓扑与微分几何，动力系统，代数与组合数学，调和分析和偏微分方程，概率论，统计学，计算数学，信息科学，数学物理，金融数学。这些领域的研究都在蓬勃发展。

实验室拥有一级学科博士授予权，涵盖全部数学学科；拥有全部四个数学二级学科的国家重点学科。

现任实验室主任是张平文教授。实验室副主任是蒋美跃教授和甘少波教授。

现任实验室学术委员会主任为文兰教授，他是中国科学院院士，第三世界科学院院士，中国数学会第九届理事会理事长。学术委员会顾问为张恭庆院士、姜伯驹院士、丁伟岳院士和田刚院士。

历届主任

张恭庆（1989-2004） 丁伟岳（2004-2010）

张平文（2010-现在）

历届副主任

应隆安（1989-2001） 田 刚（1989-2001）

张继平（1989-2008） 王长平（2001-2003）

陈大岳（2003-2008） 蒋美跃（2003-现在）

张平文（2008-2010） 甘少波（2010-现在）

第一届理事会

理事长： 姜伯驹

副理事长： 张恭庆

理事： 丁伟岳，马志明，堵丁柱，史树中，李邦河，邓东皋，忻元龙

冯克勤，石钟慈，陈永川，徐超江，肖 刚，石青云，郑忠国

彭立中， 文 兰，杨 乐，成 平，章祥荪，李 忠，董镇喜

名誉主任： 丘成桐

主任： 张恭庆

副主任： 应隆安，田刚，张继平