中国文化遗产研究院的前身,1956年1月，
文化部决定
北京文物整理委员会更名为古代建筑修整所
中华人民共和国建立后不久，文化部成立北京文物管理委员会，他继续任秘书。在此期间，他对
北京的132个名胜古迹作了考察和研究，并对首都的新城规划、
古建筑和
名胜古迹的去留问题，提出了许多很有价值的意见和看法。
为古代建筑修整事业做出贡献 从1947年起，俞同奎任北京文物整理委员会秘书。他提出要做到不让一处“横遭破坏”，也不让一处“滥竽充数”，提出了5条必须保留的古建筑标准：①具有悠久历史的宫殿、苑囿和名胜古迹；②与革命有关的建筑；③明代以前的原建筑；④建筑式样特殊，可供学术研究与参考者；⑤建筑内部附有不可分离的文物，具有高等艺术价值者。 1956年，北京文物管理委员会改为文化部古代建筑修整所，俞同奎担任所长。这时他已年逾八旬，但仍对维修和整理中国的文物古迹辛勤筹划，不遗余力。尤其是对北京地区的一些重要文物古迹，认真组织普查、修复，无论是宫殿园林，还是坛宇寺庙，他都亲自勘查、访问，提出维修方案和保护措施。他认为从一个民族的建筑艺术，可以看出它的民族文化水平。中国是一个历史悠久的文明古国，前人给我们留下了许多珍贵的可供研究的
民族文化遗产，如不加以珍惜、保护，势必逐渐毁灭。 俞同奎对古建筑的寿命问题、损坏原因、现存古建筑的破坏情况、古建筑的保存原则、保存方法以及古建筑工程等问题，曾做过较深入的调查研究，他提出的一些做法和见解，至今仍有重要参考价值。
1945年后，北平市工务局设“文物整理工程处”。1947年，国民党政府行政院设“北平文物整理委员会”，初委任朱启钤为主任，朱以年老推辞；继由考古学专家马衡为主任，梁思成等学者专家为专门委员，曾任北平大学工学院院长的俞同奎任秘书。因为当时政治腐败，经济凋蔽，没有实际工程。但通过这个专门机构集中了一批建筑学出身的专门人才，他们成为新中国第一代文物保护事业的骨干力量。1949年，文物整理工程处改组为直属文化部的“古代建筑修整所”，俞同奎任所长。