1285年12月6日，费尔南多在塞维利亚出生。他是卡斯蒂利亚和莱昂国王
桑乔四世和玛丽亚·德·莫利纳的长子。他在
塞维利亚大教堂内接受了雷蒙多·德·洛萨纳大主教的洗礼。他被立即宣布为王位继承人并且接受了王国贵族们的效忠。桑乔四世将费尔南多委托给费尔南·佩雷斯·庞塞·德·莱昂抚养。费尔南多和导师一同离开了萨莫拉，前往费尔南·佩雷斯的家中居住。国王还将伊希德罗·冈萨雷斯和阿方索·戈迪尼斯任命为王子的大臣，将塞缪尔·德·贝洛拉多任命为王子的财政总管。费尔南·佩雷斯·庞塞·德·莱昂和他的妻子乌拉卡·古铁雷斯·德·梅内塞斯对费尔南多的性格产生了重要的影响，即使当他成为国王后，他也依然会对费尔南·佩雷斯夫妇表现出深切的感激之情。
1295年4月25日，桑乔四世在托莱多去世，他将王位留给了不满10岁的长子费尔南多。费尔南多的母亲玛丽亚·德·莫利纳成为了摄政王。由于玛丽和桑乔三世的婚姻不具备法律效力，所以她与桑乔三世的所有子女都是非婚生子。因此，玛丽亚不得不解决无数的问题以保住自己儿子的王位。由卡斯蒂利亚国王
费尔南多三世之子恩里克和卡斯蒂利亚国王
阿方索十世之子胡安分别领导的两派卡斯蒂利亚贵族之间爆发了持续不断的争斗，阿拉贡、
葡萄牙和
法国也想在卡斯蒂利亚王国政局动荡之际乘虚而入。与此同时，包括比斯开领主迭戈·洛佩斯五世·德·哈罗、努纽·冈萨雷斯·德·腊拉和胡安·努涅斯二世·德·腊拉在内的众多贵族也开始陷入无政府状态。
在1295年召开的巴利亚多利德会议上，恩里克被选派为国王的监护人。但玛丽亚却依然获得了国王的抚养权。在会议召开后不久，胡安就离开了
格拉纳达并且企图攻占
巴达霍斯。胡安的计划并未成功，但他却占领了科里亚和阿尔坎塔拉城堡。之后，他来到
葡萄牙王国强迫葡萄牙国王
迪尼斯一世对卡斯蒂利亚王国宣战，并且要求葡萄牙支持他对卡斯蒂利亚王位的宣称权。
1295年夏，玛丽亚和恩里克在罗德里戈城与葡萄牙国王会面。在会谈期间，双方达成了费尔南多与葡萄牙国王
迪尼斯一世的女儿
康斯坦萨以及费尔南多的妹妹
比阿特丽斯与葡萄牙王位继承人
阿丰索四世之间的两桩政治联姻。与此同时，迭戈·洛佩斯五世·德·哈罗被确认为比斯开领主，而在私下承认费尔南多为卡斯蒂利亚王国君主的胡安也被立马归还了财产。