新疆农业大学农学院是新疆农业大学下设的二级学院。

1952年8月，新疆八一农学院农学系创建，是学校首批成立的6个系之一。

1995年4月21日，由农学系和植物保护系合并成立农学分院。

1998年12月，正式更名为新疆农业大学农学院。

2019年，先后获批教育部“三全育人”综合改革院（系）试点单位、自治区总工会“劳模和工匠人才创新工作室”“棉花教育部工程研究中心”和“丝绸之路经济带棉花优质高效省部共建协同创新中心”；同年，获新疆维吾尔自治区先进基层党组织荣誉称号。

截至2020年5月，学院设置5个系，设有4个本科专业。

系：作物工程系、植物遗传育种系、植物病理系、昆虫与农药学系、生物技术系

本科专业：农学、植物保护、生物技术、种子科学与工程

截至2020年5月，学院有教职工79人，专任教师61人，其中教授16人，副教授21人，具有博士学位40人（占专任教师的65.6%）。博士生导师14人，硕士生导师38人。17人有博士后工作经历。18人有国外访学经历。全国“五一巾帼标兵”1人，“全国各族青年团结进步优秀奖”1人，“全国青年创业导师”1人，“新疆青年五四奖章”1人，“天山学者”特聘专家4人，柔性引进自治区高层次人才天池计划1人，自治区教学名师3人，自治区教学能手1人，自治区第一批“首席科学传播专家”1人，“新疆自然科学专家”4人，自治区“科技特派员”2人，39人次入选自治区级人才项目（占专任教师的61%），“曲延英教授创新工作室”被自治区总工会命名为“劳模和工匠人才创新工作室”。

新疆青年五四奖章：倪志勇

新疆自然科学专家：马德英等

自治区教学名师：张巨松等

自治区教学能手：马德英

自治区“科技特派员”：石书兵等

自治区“首席科学传播专家”：马德英

自治区“万人计划”高校自然科学领域青年拔尖人才储备人选：倪志勇

自治区天山英才工程第二期第二层次培养人选：倪志勇、汤秋香、马德英

自治区天山青年计划杰出青年科技人才：耿洪伟、倪志勇

自治区天山青年计划优秀青年科技人才：汤秋香

自治区青年科技创新人才培养工程优秀青年科技人才：倪志勇

截至2020年5月，学院拥有1个博士后科研流动站，1个一级学科博士学位授权点，2个一级学科硕士学位授权点，6个二级学科硕士学位授权点，1个硕士专业学位授权领域，1个自治区重点学科（高原学科）。

博士后科研流动站：作物学

一级学科博士学位授权点：作物学

一级学科硕士学位授权点：作物学、植物保护

二级学科硕士学位授权点：作物栽培学与耕作学、作物遗传育种、植物病理学、农业昆虫与害虫防治、农药学、生物化学与分子生物学

硕士专业学位授权领域：农艺与种业

自治区重点学科（高原学科）：作物学

截至2020年5月，学院拥有国家级一流专业建设点1个，国家特色专业2个，自治区级一流专业建设点1个，自治区重点产业紧缺人才专业1个；主持国家级精品视频公开课1门；建成国家级高校大学生校外实践教育基地1个，自治区级实验教学示范中心1个；建有4个自治区优秀研究生产学研联合培养基地，16个专业学位实践基地。

国家级高校大学生校外实践教育基地：新疆农业大学-新疆华西种业有限公司

国家特色专业：种子科学与工程、农学

国家级一流专业建设点：农学

自治区级一流专业建设点：植物保护

自治区重点产业紧缺人才专业：种子科学与工程

自治区级实验教学示范中心：作物生产类实验中心

截至2020年5月，学院累计获教学成果奖国家级一等奖1项、国家级三等奖1项，自治区级二等奖1项，校级一等奖1项、校级二等奖5项、校级三等奖3项；获校级授课竞赛十佳教学能手2项、优秀个人奖1项，获全国高校微课大赛一等奖1项，三等奖1项；大学生创新项目国家级25项，自治区级28项；自治区级研究生科研创新项目19项，校级研究生科研创新项目17项。

截至2020年5月，学院建成教育部工程研究中心1个、自治区资源共享平台1个、自治区重点实验室1个、自治区协同创新中心1个、自治区教育厅重点实验室1个，校级重点实验室5个。

自治区资源共享平台：新疆特色果树病害标本资源库及服务平台

截至2020年5月，2015年以来，学院获得农业部“农牧渔业丰收奖”二等奖2项；国家科技进步二等奖1项；自治区科技进步一等奖2项、二等奖5项、三等奖3项；获国家发明专利19项，审定棉花、大豆、玉米等新品种11个，计算机软件著作权10个，制定并实施地方标准4项，主编专著17本；在中国国内外公开学术刊物上发表科研论文共计发表论文617篇，其中SCI收录29篇；近五年主持国家重点研发项目、国际合作项目、国家自然科学基金等项目43项，省部级27项，研究经费3500余万元。

据2022年2月学院官网显示，学院曾举办“建党九十九周年”主题手抄报活动、“三进两联一交友”暨庆元旦，迎新年活动、三进两联一交友暨昆虫知识竞赛等学生活动。