目前正在执行的科研推广开发项目31项，其中包括国家863项目、国家支撑计划和948项目子项目，
国家自然基金项目、自治区高技术、重大专项及科技攻关项目及自治区成果转化项目等。同时开展同位素农业应用研究室与环境保护研究。钴源辐照研究室开展辐射诱变育种、辐照保藏农副、畜、特产品技术对外服务。本所下属绿洲科技开发公司研究并生产棉花、小麦农作物种衣剂和作物生长调节剂。
农作物细胞工程重点开放实验室总投资近800万元。拥有整套分子生物学仪器设备。可进行基因克隆、构建、分子检测、基因转化、
分子标记辅助育种、基因功能验证等研究。实验室开展农作物优质、抗逆性状的分子生物学机理研究，带动农作物品种的遗传改良研究，突出农业生物技术研究特色。通过多学科交叉融合的创新性研究，成为自治区农业生物技术领域科技创新的源头和学科优秀人才的培养基地。