新疆维吾尔自治区总工会是中共新疆维吾尔自治区委员会和
中华全国总工会领导下的工人阶级的群众组织，是学习共产主义的学校，是联系工人阶级的纽带。它的主要任务是：广泛组织和团结新疆各族职工，努力为社会主义事业做贡献，维护职工当家作主的权利，保障工人的福利，提高工人群众的政治素质和文化素质。
新疆维吾尔自治区总工会，是
中华全国总工会的地方组织，是全疆各级各类工会组织的领导机关。自治区总工会自成立到2008年共召开了十次代表大会。
1951年5月，新疆省总工会筹备委员会成立。1954年10月，新疆省工会联合会成立。1955年10月，改称新疆维吾尔自治区工会联合会。1957年11月，选举产生新疆维吾尔自治区工会联合会领导机构。同年12月，根据中国工会第八届
全国代表大会通过的工会章程，新疆维吾尔自治区工会联合会改称新疆维吾尔自治区总工会。
从1950年开始，新疆的一些区级行业和各地、州、市、县，结合各项政治运动，积极发展工会会员，筹建工会组织。1964年12月，全疆各地、州、市、县绝大部分都建立了工会，基层工会组织达1219个，配备专职工会干部1209人，发展工会会员213736人，占职工总数的17.48%。1998年自治区工会第八次代表大会召开前，全疆绝大部分区级单位、产业系统和 3个直辖市、5个自治州、8个地区、95个县（市）区都建立了工会组织，基层工会组织达11535个；配备工会专职干部9245人， 发展工会会员2205989人，占全疆职工总数的93.2%。工会会员中，少数民族540275人，妇女932020人。
新疆生产建设兵团和各师、局都建立了工会组织。乡镇企业、三资企业、私营企业组建工会组织工作也得到开展，到1998年底已有工会组织1360个，其中外资企业56个，私营企业752个，集体企业552个。
自治区总工会成立以来，大力开展
社会主义劳动竞赛和技协活动。50年代开展了以提高技术、改进生产工具为主要内容的爱国主义生产竞赛活动的
先进生产者运动。 60年代开展以“政治思想好，生产好，管理好，互助协作好”为主要内容的系列“五好”职工活动。70年代开展了“工业学大庆”活动。社会主义劳动竞赛推动了职工技协活动的开展。50年代中期出现了职工技协活动，1984年 9月成立了自治区职工技术协作委员会。到1994年共有技协656个，人数达9万人，共完成技术更新、技术攻关和发明创造1.3万多项， 创经济效益1.85亿元，职工合理化建议 90余万件， 创造（节约）价值约19亿元。到1998年，共有技协669个，人数9万多人，共完成技术革新、技术攻关和发明创造10万项、创造经济效益2.8亿元， 职工合理化建议34557件、创造（节约）价值约1.2亿元。
自治区各级工会组织在强化和完善企业民主管理制度、维护职工合法权益及加强职工思想政治工作、提高职工素质、促进
社会主义精神文明建设中发挥了监督作用，做出了重要的贡献。50年来，自治区涌现出一大批先进模范人物。1997年，有7个单位20人获得全国“五一”劳动奖章（状），有49个单位、99人获得“开发建设新疆”奖章（状）。