黑龙江新青白头鹤国家级自然保护区地处黑龙江省东北部，小兴安岭主脉东侧北坡。保护区位于《全国林业系统自然保护区体系规划研究》所列16个中国生物多样性热点地区之一的吉林长白山地区内，处于中国东北泥炭沼泽集中分布区，拥有小兴安岭山脉保存最完整的多种典型湿地组合，被联合国教科文组织考察认定为大面积群落清晰、保存完整的典型泥碳沼泽湿地。

2004年保护区开始筹建；

2009年被评为省级先进集体，

2010年荣获省级森林资源监督管理先进单位；

2011年晋升为国家级自然保护区。

2023年11月30日，国家林业和草原局公布《陆生野生动物重要栖息地名录（第一批）》，黑龙江伊春新青湿地白头鹤重要栖息地入选。

保护区东北部与嘉荫县接壤，东南部与鹤北林业局毗邻，西北部是汤旺河林业局施业区，西南部、南部是新青林业局施业区。地理坐标为东经129°58′29″--130°23′07″，北纬48°19′21″--48°40′20″。距离黑龙江省会哈尔滨470公里，交通便利。

黑龙江新青白头鹤国家级自然保护区所处的大地构造位置是位于新华夏构造体系第二隆起带小兴安岭隆起东南侧，区内主要构造方向为北向和北北东向。地质构造前身是古生代末期海西宁运动，华里西隆起褶皱构造带，表现为北北东向和北东向的一系列断层。区域内岩浆岩主要是区域变质岩，基岩绝大部分是岩浆岩，由侵入而未喷出的结晶花岗岩和花岗片麻岩组成露出地面，喷出地面的岩浆岩形成的玄武岩。

白头鹤在地质历史上曾发生过多次强烈的地壳运动，岩浆活动，沉积作用和变质作用。在早古生代以前，为稳定的浅海环境，随着地壳运动，海槽不断下降，海底火山喷发出大量中基性火山岩，并在较深海槽里沉积了泥钙质及泥质物质，其中并有超基性岩侵入。后来，地壳运动又表现为上升为主，升降震荡，接受了陆源碎屑沉积。受加里东运动的影响，表现为隆起地块，受裂陷作用的影响，地块活化，裂陷，发育了陆相中酸性火山岩及湖泊沉积。

白头鹤境内有较大河流十一条，以小兴安岭为界，形成东西两大水系。小兴安岭以东归黑龙江水系的有嘉荫河、小渔河、笑山河、乌拉嘎河、西北岔河、柳树河、结烈河。小兴安岭以西归松花江水系的有汤旺河、抗美河、援朝河、头道新青河。

白头鹤保护区在植物区系构成上属长白植物区系（亦称满洲植物区系）。按中国植被区划理论归于小兴安岭——老爷岭植物区的小兴安岭——张广才岭亚区。保护区内植物资源极为丰富，分布有174科1011种，其中地衣植物12科80种，苔藓植物53科169种，蕨类植物14科49种，裸子植物2科7种，被子植物93科706种。根据1999年国家林业局和农业部联合发布的《国家重点保护野生植物名录（第一批）》，保护区分布有国家珍稀濒危Ⅱ级保护植物7种，即红松、浮叶慈菇、野大豆、水曲柳、钻天柳、黄檗和紫椴。

黑龙江新青白头鹤国家级自然保护区以“中国白头鹤之乡”响誉国内外，有着丰富的野生动植物资源。区内分布着近90只白头鹤，约占全球总量的1%。脊椎动物81科331种，其中鱼类13科39种，两栖类4科8种，爬行类3科10种，鸟类46科223种，兽类15科51种；昆虫101科465种；土壤动物42科67种；真菌59科480种。国家Ⅰ级保护动物有紫貂、原麝、白头鹤、丹顶鹤、东方白鹳、金雕6种，国家Ⅱ级保护动物有驼鹿、黑熊、马鹿、乌林鸮、苍鹰、普通鵟、花尾榛鸡、白枕鹤等42种，省级一般保护动物174种。

保护区以保护白头鹤资源与其他珍稀濒危野生动植物资源、北温带森林生态系统和湿地生态系统及生物多样性、黑龙江流域上游的水源涵养地为保护对象。

区内山青、水秀、石奇、林幽，特殊的地理位置、地形地貌和森林资源形成了独特的自然景观，具有丰富的生物多样性。在物种组成、区系特征、群落结构或生态系统水平上，均反映了小兴安岭特色，是小兴安岭地区的典型代表。是集珍稀濒危野生动物保护、生物多样性保护、湿地资源保护、科学研究、宣传教育、生态旅游与森林可持续利用等多项功能于一体的“野生动物类型”自然保护区，对于小兴安岭地区生态平衡研究中具有重要的地位。

黑龙江新青白头鹤国家级自然保护区成立了管理局—管理站—管理点三级管理机构，制定和完善了相应的规章制度及保护条例，为保护区的依法保护和管理提供了依据。保护区的建设和发展走上了科学发展的轨道。