旗舰物种译自英文“flagship species”， 指某个物种对社会生态保护力量具有特殊号召力和吸引力，可促进社会对物种保护的关注，是地区生态维护的代表物种。

·亚洲有些地方以黑脸琵鹭作为保育它们生存环境的代表物种。

·台湾曾有人以水雉（凌波仙子）作为争取保育水雉繁殖区，并带出高速铁路横跨的问题。

·香港曾以彩鹬作为保育塱原湿地的代表鸟种，免受铁路贯穿割裂。

·广西崇左市以白头叶猴是当地生存环境的旗舰物种，保护白头叶猴就是保护该地的环境，也就是保护当地人们的生活和子孙后代继续生存的可能性。

这类物种的存亡一般对保持生态过程或食物链的完整性和连续性无严重的影响，但其魅力（外貌或其他特征）赢得了人们的喜爱和关注（如大熊猫、白鱀豚、金丝猴等），这类动物的保护易得到更多的资金从而保护了大规模的生态系统。

2013年1月，世界自然基金会（以下简称“WWF”）发布了题为《中国生态足迹报告2012》的调查报告。该报告从生态足迹、水足迹和地球生命力指数等方面分析了我国经济发展与生态环境的变化。其中最引人关注的一项调查结果是：改革开放以来，中国人均消费水平随着城镇化和收入的提高而迅速拔高，而生产效率的提高速度则远低于人均消费水平，进而造成我国的生态超载情况持续加重，“生态赤字”不断增大。

在地球生命力指数方面，该报告通过调查我国多个生态系统中“旗舰物种”的生存状况，分析这些生态系统所面临的挑战。在东北虎、大熊猫、亚洲象、海南长臂猿、野生双峰驼、白鱀豚、扬子鳄、朱鹮、麋鹿、青海湖裸鲤、麝、新疆北鲵等各自生态系统的“旗舰物种”当中，除朱鹮和麋鹿外，其余物种在20世纪60年代至80年代都出现了急剧下降的趋势，一些物种甚至濒临灭绝。

进入20世纪80年代，这些重点濒危物种虽然得到了保护，但除了大熊猫、亚洲象的数量缓慢回升外，其余物种的生存状态并未好转。