共分为5个展室，展示了从3万年前旧石器时代日本文化的曙光到当代日本文化的漫长历史过程，我们从中看到了独具特色的日本文化。博物馆展示了作为岛国的日本文化在世界体系、亚洲体系以及日本本土的不同人群力量的交融碰撞过程中，是如何产生发展并形成独具自己民族特色的文化。
1977年动工建造，1983年起陆续开放。占地面积 115232 平方米，建筑面积为 31162平方米。主要收藏日本的历史、文化、考古、民俗方面的文物、资料。陈列分四大部分，设19个专题，按历史年代顺序展出史前至近代的文物史料。另外，还有大量的复制品和模型等辅助陈列。第一部分为日本的石器时代至 9世纪，展出石器、陶器、稻耕文化、平城京遗址出土文物、受中国唐代文化影响的文物等。第二部分为平安时代中期至战国时代，展出日本的王朝文化、文字(片假名、平假名)的出现，农民起义、民众的生活与文化等实物和模型。第三部分是封建领主统一政权的形成至近代，展示了城市的发展和工商业的繁荣，以及16世纪欧洲
外来文化影响下出现的文化、贸易和基督教等方面的实物。第四部分是日本人的民俗世界，展出有关乡村、山区、沿海、海岛居民的生活习俗、祭祀信仰等实物。该馆积极开展研究工作，设有情报资料研究部、历史研究部、考古研究部和民俗研究部。