位于日本东京的樱美林大学起源于1921年清水安三在北京创立的崇贞学园。大学自创立以来，长期重视汉语和中国文化的教学与研究，重视与中国的友好交流。2005年11月1日，樱美林大学与中国国家汉办及同济大学合作建立了东日本地区首家孔子学院--樱美林大学孔子学院，并于次年11月1日，在日本滋贺县高岛市开设了樱美林大学孔子学院高岛学堂。

樱美林大学孔子学院是同济大学与日本樱美林大学合作设立的。2005年11月1日签署协议，2006年 4月1日学院正式启动。学院设于樱美林大学内，常规教学活动包括：与学历教育接轨的汉语特别课程、面向社会的汉语及中国文化学习班、企业汉语培训课程、高中生汉语体验课程等。此外，樱美林大学孔子学院每年都会组织和举办一些汉语和文化交流推广活动，例如：全日本青少年汉语卡拉OK大赛、 “汉语桥”世界中文比赛东日本选拔赛的承办、春节联欢会、汉语广场、中日传统文化交流讲演会、中国文艺戏曲演出、中国文化体验活动等。樱美林大学孔子学院还开展有本土师资以及本土化师资培训项目、知名学者讲演活动、组织编写学术年刊《汉语与汉语教学研究》等。

2010年底，樱美林大学孔子学院被授予“先进孔子学院”荣誉称号。

学院自开设以来，致力于开发高水平的汉语课程，扩大汉语学习人口，并积极推介中国文化，促进中日民间交流。学院的工作主要由汉语教学课程、汉语与中国文化研究、青少年交流与文化交流、社区服务等四个方面组成。

在教学课程方面，学院开发了汉语特别课程、面向社会人的汉语与中国文化课程、面向企业的汉语研修课程、汉语师资培训课程、中学生汉语体验课程、短期留学等项目。其中与大学学历课程接轨的汉语特别课程填补了日本汉语教学中特训强化课程的空缺。

在汉语与中国文化研究方面，学院有计划地组织编写汉语教材、中国文化丛书与《孔子传》，并计划2010年上半年创办《汉语与汉语教学研究》学术年刊。

在青少年交流与文化交流活动方面，学院成功开发的全日本青少年汉语卡拉OK

在为社区提供服务方面，学院与周边地区的日中友好交流团体建立稳定的合作关系，提供或帮助展开各类活动,并参加了横滨港开港150周年的纪念活动。

在近4年的时间里，学院共完成251个汉语教学课程，为3104名高中生、大学生、社会人士及企业人士提供了汉语教学。为317名大学、高中及民间组织的汉语教师进行了培训。共计19744名青少年与社会人士参加了本学院举办的文化交流活动，组织了562名青少年赴华留学或文化访中，为4104名社区人士提供了各类服务。有11806名考生在本院负责的考场参加了HSK考试。