2015年4月18日，镇江华萨足球俱乐部在
镇江体育会展中心召开新闻发布会，成为中国第一家会员制足球俱乐部。同年，镇江华萨足球俱乐部首次参加
江苏省业余足球联赛总决赛，获得第6名。
2016年，镇江华萨足球俱乐部第二次参加江苏省业余足球联赛总决赛并获得冠军。同年，镇江华萨足球俱乐部参加
中国足球协会业余联赛总决赛，获得第6名，在第3名
武汉楚风合力足球俱乐部放弃中乙资格及
天津火车头足球俱乐部退出职业联赛的情况下，获得最后一个
中国足球协会乙级联赛的参赛资格。
2017年，镇江华萨足球俱乐部以5平17负的成绩获得
中国足球协会乙级联赛第21名。
2018年6月30日，镇江华萨足球俱乐部在主场以2比0力克江西联盛足球俱乐部后，完成俱乐部在镇江体育会展中心的最后演出。8月4日，镇江华萨足球俱乐部首次在昆山体育中心体育场对阵云南飞虎足球俱乐部。2018年7月，镇江华萨获得中国足球协会乙级联赛第13名（南区第7名）。
2020年11月26日，中国足球协会杯第2轮，昆山足球俱乐部以3比0爆冷淘汰广州恒大淘宝足球俱乐部，闯入8强。2020年，昆山足球俱乐部获得中国足球协会甲级联赛季军。
2022年5月1日，昆山足球俱乐部与主教练塞尔吉奥-萨尔科完成续约。此外，昆山足球俱乐部与球员
汪佳捷、
朱峥嵘、
余鉴贤完成续约。6月22日，中国足球协会甲级联赛第4轮，昆山足球俱乐部以3比1击败南京城市足球俱乐部。7月18日，中国足球协会甲级联赛第9轮，昆山足球俱乐部以3比1击败新疆天山雪豹足球俱乐部。9月8日，
傅欢租借加盟昆山足球俱乐部。11月11日，中国足球协会甲级联赛第29轮，昆山足球俱乐部以4比1击败淄博蹴鞠足球俱乐部，以24胜5平的不败战绩提前5轮获得中国足球协会超级联赛参赛资格。11月25日，中国足球协会甲级联赛第31轮，昆山足球俱乐部提前获得联赛冠军。12月3日，中国足球协会甲级联赛第33轮，昆山足球俱乐部以2比0击败四川九牛足球俱乐部，以86分创造中甲联赛历史最高积分纪录。12月8日，中国足球协会甲级联赛第34轮，凭借伊尔德·贝尔托的进球，昆山足球俱乐部以1比0击败淄博蹴鞠足球俱乐部，最终以28胜5平1负的成绩问鼎2022赛季中国足球协会甲级联赛冠军，冲超成功。
昆山足球俱乐部队徽采用圆形外框，基于昆山龙头经济的特性融合团龙的图形，结合昆山地貌元素玉峰山，表现昆山足球的蓬勃发展和各环节的配合。昆石作为昆山的瑰宝，队徽中以石块为外形，祥云纹表示昆石肌理，设计昆石图形，配于队徽左右，突出球队如昆石一般坚韧顽强、出类拔萃。
昆山足球俱乐部主场球衣以蓝色为主色调，六边形的旋转暗纹，为江南传统建筑中的“窗” 图形，使球衣具有历史与时尚感。腰线位置采用深蓝色织带拼接，使球衣在视觉上显得修饰身形；客场球衣以白色作为主色调，白色大身使得球衣暗纹更加精致。后背领口“你我共昆山”点晴之笔，突出为昆山城市而战的地域荣耀。