昌源河，黄河支流汾河的主要支流之一，《水经注》称胡甲水，又称候甲水（古时候、胡同音），下游俗呼“沙河”。此外，尚有龙舟水、隆舟水、龙舟峪、龙州谷、隆舟谷、龙猪谷等名称，大抵据谐音演变而成。

昌源河上游在平遥境内，主河道分东、西两支。东支发源于朱坑乡东西沟，流经阮家庄、张家庄、贾封、康家庄、石宝等村；西支发源于仁义沟西沟庄，一说东泉镇（原孟山乡、仁义乡）南花庄村（一说平遥县孟山乡斜坡村老峪底），流经魏家庄、二郎、下石庵等村，在石门村上游2.50公里处两支汇合后武乡县分水岭乡南关村（汇《祁县志》所称南源），经石门流入祁县。以西源为正源，平遥境内全长31.50公里，流域面积184平方公里，位于一般山丘区，其中有101平方公里被森林覆盖。河床平均纵坡6.86‰。年平均径流量2100万立方米。

昌源河经武乡县南关后，北入祁县来远镇，汇合南凤沟、东峪沟诸支流，经盘陀出子洪口，转向西北，经洛阳、鲁村间，涧村、涧壑间，河湾、武乡间，东六支、南社间。刘家堡、塔寺间，贾令、里村间至丰固村西北与乌马河汇合，再于苗堡村折向西南，在思贤村南（思贤、原西村间）注入汾河。祁县境内75公里。纵贯来远、峪口、古县、东观、西六支、贾令、城关、里村8个乡镇。

昌源河干流全长88.55公里（一说晋中境内河长93公里）流域面积1011.16平方公里。祁县境内744.96平方公里，平遥县境内182平方公里（一说184平方公里），武乡县境内84.2平方公里。

据《祁县志》，昌源河多年平均径流量为7190万立方米。最大流量为2050立方米/秒（1977年7月6日）。清水流量为0.298立方米/秒，枯水季节最小流量仅0.01~0.02立方米/秒。流域区内的降水量，上下游有差别，由上而下依次递减，多年平均降雨量，上游为510.7毫米，中游丘陵地区为467.7毫米，下游平原区为437.8毫米。多年平均蒸发量为1575毫米。平均输沙量为60万吨。逸流由山泉和降雨形成，水质较好，适于农田灌溉。矿化度一般在0.2克/升左右。

据《晋中市志》，昌源河干流子洪水库以上多年平均径流6370万立方米（1956年~1984年），实测年平均径流全6187.6万立方米（1954年~1989年）。河床平均纵坡6.86‰，侵蚀模数每平方公里887吨。

滹溪河，古称通光水，又名胡溪河、伏西河、胡城水，属境内内流河。发源于峪口乡上庄村君寨沟，下流至东观镇一带，河床逐渐趋于消失。是一条季节性的无尾河。全长20.5公里，流域面积52.8平方公里。峪口以上清水流量为0.015立方米/秒，年平均流量484万立方米，输沙量9万立方米。1958年和1972年，分别在中、上游修筑鲁村、杜家庄两座小型水库。自此，鲁村以下一般年景枯涸无水。南团柏村以下，河滩已大多开垦种地或植树造林。旧志载，通光水出谷后，合太谷县胡城谷水，经东观等村北流，至县西北汇入昌源河，而后入汾河。

乌马河，一名五马河，亦称回马谷水，俗称回马河。上游分东、西两源，以西源为正源。出祁县、太谷交界，下黑峰、通天沟一带。东源出榆社县黄花岭。合流后经回马口出山，纵贯太谷县境，于晓义至北堡间入祁县，又于牛家堡村北转入清徐县，再向南从贾令镇北左、左墩间折回祁县，经夏家堡、西阳羽间，西高堡、前家营间西流，至丰固村北汇入昌源河。全长93公里，流域面积500平方公里。祁县境内流长17.2公里，流域面积47.02平方公里。乌马河季节性极强，对祁县基本无灌溉之利。然而一到洪水季节，往往洪流直泄，毁堤决捻，造成严重水害。

阎灿河，古称石佛河，境内内流河。源出祁任村乡柏泉头村南山坡，由南向北穿越祁任村、古县两乡镇境，下流至城关乡下申村一带散浸入田。1955年，昌源河灌区一干渠建成，与阎灿河形成十字交叉，于下阎灿村穿涵洞而过，下游在大韩村汇入西支干渠。全长11.5公里，流域面积25.25平方公里，年平均通流量120万立方米。上游杨庄村建有小型水库1座。

王贤河，古称伏罴水，又名王斜河。源出祁县祁任村乡伏坪村，北流入古县镇境。一干渠建成前经王贤村东入昌源河，现汇入一干渠。全长8公里，流域面积20平方公里，年平均通流量为95万立方米。

东峪沟，又名东鱼沟。长18公里，纵坡度为20‰，高差360米。汇集来远镇东南16条较大沟谷之水入昌源河。

南凤沟，源于来远镇后庄村东南，由东向西汇入昌源河，长10.3公里。

左家滩沟，源于峪口乡天池凹村东，由东南向西北至峪口乡左家滩村西汇入昌源河，长7公里。

南河沟，源于来远镇后沟村西1公里处，由西南向东北至谷峪口村东汇入昌源河，长6.8公里。

石弓沟，源于来远镇化塔村，由东北向西南至来远镇汇入昌源河，长6.8公里。

石沙沟，源于来远镇南庄村南，由西向东汇入昌源河，长5.4公里。

碾子峪沟，源于麓台山东南，由西向东至来远镇北关村汇入昌源河，长4.8公里。

张里沟，源于来远镇石佛窑村北1.5公里处，由西南向东北至来远镇汇入昌源河，长4.7公里。

赶鱼沟，源于来远镇石佛窑村东，由西向东至来远镇红子山村汇入昌源河，长4.5公里。

据旧志载，明代以前，昌源河水远比现代丰盈。其时，祁县南山一带，树木葱茏。昌源河西、南两流汇合北入祁县，在北关随着地势变化，形成一大跌落，河床渐宽，河水清浅而缓慢，涂涂睁净，流向盘陀。沿途有诸山泉来归，水流越来越大。人们依河开渠，引水灌溉，“祁以此丰富”。古人还在河边岸上种了许多竹子。其竹“云稍修纤，不绿而白，若太始雪”。“昌源春水”与“龙舟夜月”成为“昭徐八景”中两处引人入胜的自然景观。明嘉靖以后，“民风渐侈，竞为居室，南山之木，采无虚岁”。更严重的是，在无节制的采伐之后，不思补栽更新，反而“垦山为田”，“寻株尺孽，必铲削无遗”。由此带来严重恶果，“天若暴雨，水无所碍，朝落于南山而夕即达于平壤矣。延涨冲决，流无定所。”“坏民田者不知其几千顷，淹庐舍者不知其几百区也”。“祁之丰富减于前者什七矣”。

1968年，在上游来远镇北关村修筑小型水库1座。1971年，又在中游古县镇子洪村修筑中型水库1座。次年秋，开始蓄水运用。水库控制面积控制面积576平方公里，库容为2300万立方米。此外，上游平遥县境内，尚有仁义水库工程1处。

鲁村水库，1958年3月动土兴建，位于滹溪河中游鲁村东北，共组织了1220个民工，经过163天，到8月16日建成。主要工程是拦河土坝，底长113米，顶长184米，高21.5米，顶宽4米。大坝左面有直径1.1米的输水洞，洞长86米，最大泄洪量2立方米/秒。无溢洪道。设计总库容为278万立方米，有效库容145万立方米。设计效益1万一亩，实际达到5400亩。设计标准为50年一遇，校核标准为百年一遇。1972年后由于上游修成杜家庄水库，鲁村水库基本成了干库。但是，一遇到洪水，它又是险库。

北关水库，1968年10月兴建，位于昌源河上游的北关村南，历时一年半，于1970年2月竣工。大坝为浆砌石重力溢流坝。坝高19.5米，底长50米，顶长81米，顶宽2.8米。坝体下有4个直径为1.4米的放水压力涵洞。坝顶最大泄洪量为85立方米/秒。放水洞最大泄洪量为85立方米/秒。库容设计为120万立方米，有效库容88万立方米。实际受益面积4000亩，控制面积为320平方公里。主要功能是调节洪水。由于大坝左侧为红砂岩，蓄水后坝体严重漏水，1977年7月6日，大坝左边被洪水冲垮40余米，失去控水效能，不能正常使用。

杨庄水库，1968年10月兴建，位于阎灿河中游的杨庄附近，为防灌兼用的小（二）型水库建设。大坝为浆砌重力坝，高16米，顶长85米，顶宽2米，坝底有高2米，宽1米的矩型放水涵洞，最大泄洪量3.5立方米/秒。没有溢洪设备，发大水时从坝上溢流。水库上游一干流长5公里，控制面积13平方公里，设计总库.容为34万立方米，有效库容为24万立方米，防洪库容2万立方米。灌溉面积3000亩。1992年下游渠道工程完成。一干渠由水库向北至下阎灿村，全长3公里，其中防渗渠道2.3公里，倒虹吸管870米，直径0.5米。受益村10个，灌溉面积3090亩。

子洪水库，位于昌源河中游的祁县峪口镇左家滩附近子洪口，1971年7月库区公路改建工程上马，11月第一期工程开始，组织了3000民工进人工地，在截潜流工程基础上筑坝，1972年开始蓄水。水库第一期工程设计标准为百年一遇，没有校核标准。整个工程的主体部分由32米高的土坝和4米内径的输水洞组成，无溢洪道设施。控制流域面积为576平方公里，库容1100万立方米（一说正常蓄水位888.2米，总库容2309.6万立方米，死库容102万立方米）。同年冬和1973年冬、1974年春，大坝曾3次出现多处裂缝。前两次及时采用浅孔灌浆进行处理。第三次进行大坝翻修一重新回垫碾压，并采取混凝土隔墙办法处理。为保证安全渡汛。1976年4月开始建设渡汛抢险工程，在输水洞左侧的岩石上开挖5.2米内径的泄洪隧洞。7月25日二期工程上马，组织了全县2500民工，用了4年多时间，到1980年12月完成。大坝底长50.2米，顶长230米，坝高增至44米，顶宽4米，库容达到2442万立方米。工程设计标准为百年一遇，500年校核。输水洞位置在大坝左侧，洞的直径4米，洞长247米，进口底部高程856.15米，纵坡20%，进口安平板钢闸门，最大泄洪量为322立方米/秒。水库自修建以来，基本上是边建边发挥效益。但由于无溢洪道，每年汛期要空库迎洪，弃水量很大，十余年来，利用水量的年平均数只有2220万立方米，占来水量的40%左右。设计灌溉效益18.4万亩，实际受益面积为12万亩。在管理上，水库与灌区合一，在水库下游4.6公里处建有引水建筑物，由滚水坝、泄洪洞组成。滚水坝长54米，高7.2米，顶宽3.6米。

杜家庄水库，1972年10月开工兴建，1979年3月竣工。位于滹溪河上游杜家庄东南面。大坝为浆砌石重力坝，坝顶溢流排洪。坝高28米，非溢坝29米，溢流坝长30.5米，最大泄洪量66立方米/秒。坝顶长114米，坝左底端建有直径1.25米的泄洪洞，最大泄洪量17.2立方米/秒，右端有两孔直径。·25米的放水钢管。水库控制面积41平方公里，设计总库容为119万立方米，有效库容101万立方米，防洪库容13万立方米。水库设计标准为50年一遇，校核标准为百年一遇。设计灌溉面积1.2万亩，实际达到8000亩。

庞庄水库，位于乌马河上游太谷区高庞庄1公里处，是全省第一座半动力式堆石坝中型水库工程。1971年7月筹建，1974年11月竣工。1974年1月，由国家投资又建成装机2台70千瓦的坝后小型发电站一处。1979年，因发现坝基渗漏严重，国家拨款进行帷幕漏浆处理。水库枢纽工程包括拦河大坝、输水洞、溢洪道、第首引水工程和坝后发电站五部分。坝高4米，顶长380米，底宽4.米，顶宽4米。水库以上干流长31公里，控制流域面积278平方公里，总库容1800万立米，防洪能力为二十年一遇洪水设计，百年一遇洪水校核。

昌源河灌区。明洪武以来数百年间，在昌源河上曾兴修了不少引水渠道，计有青布古渠、紫红渠（包括上、中、下三渠）、龙济渠、官渠、斜渠、沙渠、小沙渠、贾令渠、修善新韩渠、塔寺谷恋小渠、公利渠、大东渠等。至光绪初全县已形成较大的农田灌溉网络。但缺乏统一规划，管理失控，致使其中一些渠名虽存而无实用意义。洪水大时，冲坝决捻，任水白流，洪.水小时，又被上游所堵截，争水事件时有发生。号称11万亩水地，每年可浇者不足50%，1918年后，阎锡山政权大兴“六政三事”，对县境内渠系有过一番整顿，汰除了其中一些废渠，加固了官渠、龙济渠、大东渠、贾令渠、沙渠等主要渠道，引洪灌溉一度呈规范局面。正常情况下每年可浇地8万亩左右。以后由于战乱不断，民不聊生，水利事业基本没有发展，原有渠道因年久失修，大部废弃。

新中国建立后，随着农业生产的恢复发展，水利事业也出现了新局面。1952年3.4月，完成龙济、公利两大干渠的改建工程、总长10余公里，投工2.61万个，动土1.49万立方米。使7万亩土地的灌溉周期由3个月缩短为20天。1953~1954年，大力修复河道，在刘家堡河段筑防护坝1万余米，东六支南社间铁路桥东西两岸筑堤共5000米。1956年，昌源河灌区大力恢复与改建旧渠道，各干、支骨干渠道扩、改、修整，逐步配套，清除了以前沿河扒堤行水的混乱现象。把27个进、水口合并为5条干渠引水，保浇水地由8万亩发展到14万一亩。进入1990年代，昌源河灌区已成为定型格局。三条干渠最大吃水量为35立方米/秒。各支干总长65.5公里，建筑物227处，支、斗渠共266条，布局合理，管灌溉面积扩大到18.4万亩。

一干渠：新开渠道，由子洪段拦河滚水坝引水，经部北、梁村、元台沟、王贤、上古县、下阎灿、蒲桑、阎漫等村沿丘陵边堰通过，全长14.2公里，共有落差和闸门等建筑物41处。引水流量为5立方米/秒。有支渠9条，斗渠57条，新增灌溉面积5.17万一亩。

二干渠：由涧村段引水，经武乡、榆林、永安、东观等村地段。以下分3条支渠；一支到白圭村，二支到张庄南、北村，三支到东六支、东高堡、大贾村。

三干渠：由大韩段引水到韩家庄。

四干渠：由河湾段引水，经梁家堡、南社到一西六支。

五干渠：由刘家堡段引水，经谷恋、塔寺、沙堡等村地段，至贾令五道渠。

滹溪河灌区。清末至民国初，滹溪河有6条渠道。分别是南渠、峪日村下渠、南梁下渠、龙丈渠、黄刘渠、尚家渠。大部由当地有权有势的人把持，新中国建立后，经过综合治理，上游绿化，水土保持状况良好，1958年后下游南团柏村以下河道已改为农田。1972年，采取蓄、控并举措施。在上游杜家庄段修建水库，并从水库至峪口村南沿河436米，开了4条干渠。

九沟风景区，位于晋中盆地南部，太岳山北麓，祁县昌源河中游，是依托昌源河灌区二、三干渠取水枢纽工程形成的自然生态风景区。北距太原市60公里，西距世界文化遗产平遥古城40公里，离祁县古城20公里，距乔家大院6公里，处于晋商民俗文化旅游区中心位置。2007年10月，九沟水利风景区被评为首批省级水利风景区。

昌源河国家湿地公园，是山西省第三个国家湿地公园。昌源河国家湿地公园是以昌源河河流湿地为纽带，连接子洪水库、九沟等库塘、沼泽构成的复合湿地生态系统。河道总长36公里，总面积948公顷，总投资4.8亿元。包括河流湿地、沼泽湿地和人工湿地三大湿地类。