一对等位基因之间可能存在显隐关系，如果等位基因中一个基因的作用可以抑制另一个基因的作用，我们就称前一个基因对后一个基因为显性，相反，后一个基因对前一个基因为隐性。如控制牛角有无的等位基因中，无角基因为显性基因，有角基因为隐性基因。如果显性基因能够完全抑制隐性基因的作用，我们把这种关系称为完全显性关系，如果显性基因不能完全抑制隐性基因的作用，则称之为
不完全显性关系。为了论述和表示方便，
显性等位基因通常用大写字母表示，隐性等位基因用相应的小写字母表示。
显性基因（dominant allele）控制
显性性状的等位
基因。在二倍体生物中，杂合状态下能在表型中得到表现的基因，称为显性基因。显性基因常能形成一种有功能的物质（如酶），而它的隐性
等位基因则由于相应的
核苷酸发生了突变而不能产生这种物质，所以在
杂合体中只有显性基因能表现出正常的功能（显性）。