在《半条命1》到《半条命2》之间的约20年里，联合军对地球发动了进攻，战争仅仅持续了7个小时，人类就遭到了惨败，原黑山基地总管布林劝告人类尽快投降，以防遭到灭种的危险。结果，联合军成功占领了地球。布林则成为了联合军的傀儡，负责“管理”地球。
他们首先将人类的城市重新命名为1号城、2号城……在《半条命2》时期，17号城被设立为首都，联合军的总部暗能城堡就建造于此。为了集中人类的生存据点，联合军在各大城市周围布置了防线，防止Xen生物侵入城市，外界则任凭Xen生物泛滥，这样，大多数人都主动选择了到城市居住，外界则成了Xen生物与反抗军的空间。
在《半条命2》最后一关，主角
戈登·弗里曼利用暗能重力枪将能量光球吸起来一个个抛向城堡顶部的反应堆，导致反应堆爆炸，就在这时，时间定格，
G-man走出来说了几句话就走了，也就是《半条命2》剧情的结束。到了《半条命2：第一章》，戈登与爱丽克斯再次潜入城堡，抑制了反应堆核心。在他们乘坐火车逃离17号城的时候，城堡开始发生爆炸，可以看到许多许多联合军部队逃了出来，包括《半条命2：第二章》中正式出现的联合军探员。在《半条命2：第二章》的第一关开头，进入僵尸与蚁狮激战的矿洞前可以看到暗能城堡爆炸后四分五裂的样子。