暗黑灵石，《萌学园》系列中暗黑大帝的能量组成部分，是暗黑族的至高力量。

Dr.维多利亚在发现乌克娜娜身上具备暗黑族基因之后，首次提及冥月顽石的存在。

在谜亚星观看的暗黑档案X时，正式引出五颗暗黑灵石的存在。

冥月顽石被乌克娜娜和乌拉拉的父亲盗走，肯豆姬将其封存在乌克娜娜体内以镇压她体内的暗黑族基因，后来暗黑咒印发作的Dr.维多利亚将冥月顽石从乌克娜娜身上取走，重新交还给暗黑大帝。

黑磁石则一直被夸克族长老会封存在一间密室中，只有萌学园校长才拥有开启密室的钥匙。司徒朗继任萌学园校长之后，将黑磁石盗走，交还给暗黑大帝，但是由于里奥纳多·皮卡啾在黑磁石中加入了一滴奈亚公主的悲伤之泪，导致暗黑大帝失去了左眼的视力，司徒朗也被暗黑大帝处死。

轮回血石一直被精灵族保管着，后来B卡索将轮回血石盗走，以拍卖背包客的身份进入萌学园。在B卡索售卖物品时无意中被哈利波波拿走，并落入了桂恭仔的手中，使桂恭仔一度性情大变。在黑女巫Kiki的引诱下，桂恭仔进入地下水道，遭到暗黑族的围攻，轮回血石也被暗黑大帝回收。

海地司被前几代智之星倾尽生命能量封印在一个盒子里，辗转落到木兰家族的手中，成为木兰家族的家传信物，木兰花花将其带入萌学园。后来萌学园的暗黑族卧底发觉到海地司的存在之后将其盗走，但是被萌骑士团合力阻止。暗黑大帝为了抢夺海地司发动暗黑族人大规模进攻萌学园，熇炎自愿拿着海地司进入反噬镜，而地下水道最终也被萌骑士团使用五芒星阵封印。

熇炎带着海地司进入反噬镜后，海地司的能量打破了时空裂缝的结界。熇炎被救到精灵族的时空驿站之后，海地司流落在时空裂缝之中，被阴森女公爵夺得。

阴森女公爵拿到海地司之后从反噬镜闯进萌学园，海地司成为阴森女公爵的能量来源。地下水道被萌骑士团打开之后，阴森女公爵被暗黑大帝回收，但是她临死前将海地司交给了无言，无言又把海地司投给了焰王，海地司因此再度落入萌学园手中。

发生了海地司诱惑萌学园同学许愿事件之后，海地司被萌骑士团用五芒星阵封印在魔力收纳盒当中。后来为了治疗焰王体内的暗黑因子和恢复帕滑落地的魔法能力，海地司被取出来使用其中的暗黑能量，暗黑大帝趁机来到萌学园将海地司抢走。

至此五颗暗黑灵石全部回到暗黑大帝手中，后来阴森女公爵夺走无极能量药水之后，暗黑大帝将其吞服，成功修复了黑磁石上的奈亚之泪。

阴森女王复活之后，暗黑大帝的五颗灵石也都落入了她的手上，但是在时空战役之后，五颗暗黑灵石的力量遭到终极索雷伊圣剑极大的削弱，已经不足以为阴森女王提供足够的能量。

在异界对决之中，五位萌骑士倾尽所有力量将阴森女王和五颗暗黑灵石一起净化。

玛堡曾提及考试仍然在考察黑磁石和轮回血石等暗黑灵石。