朱衣道人案是指在顺治十一年（1654年）六月十三日，傅山因被人出卖，被捕入太原狱一事，所谓朱衣道人就是傅山的别号。

傅山以道士身份和行医作掩护，来往于孟县、平定、寿阳、祁县、汾阳和晋源一带，秘密进行反清活动。傅山的被捕与一个叫宋谦的人有关。宋谦是南明永历小朝廷总兵宋遇春之子，顺治初年就投奔到南京的福王朱由崧弘光帝处。弘光政权覆灭后，他又南下投奔到在肇庆称帝的桂王朱由榔的永历政权。由于宋谦在几次战役中英勇善战，深得南明皇帝朱由榔赏识，赐姓为朱，名朱焕慈，授予总兵之职，并发给任命书和印玺等信物，命其“招结将士，联络义兵”。

顺治四年，南明皇帝派宋谦到北方秘密活动。他在河南组织了一支反清义军，自任首领。他在山西活动化名为李谦，到陕西活动化名为李秋霸，都是用道士的身份作掩护。顺治九年、十年先后两次在汾阳会见过傅山，密谋反清之事。

顺治十一年宋谦到晋、豫、冀交界地带活动，准备利用三月十五日索堡山王母娘娘庙会起义攻占涉县。但不幸的是三月十二日宋谦等人行经武安县午级镇住宿时，因骑有骤马，带有弓矢，引起了武安县巡捕的注意。宋谦等九位首领被捕，并被查出方印、委任书和所谓的“党人簿”。在审讯中，宋谦等人先后受刑招供，供出山西的虞胤、傅山、张琦等人。招供后宋谦等人即被处死。

傅山是六月十三日在土堂村被捕的，关在太原监狱。历经太原知府边大授初审，后会同清军同知傅鸾祥、理刑推官王秉章会审，几经严刑拷问，傅山坚贞不屈，只承认宋谦来府上求见，但由于忙没时间见，更是矢口否认与宋谦密谋有关政治活动之事。傅山知道宋谦已死，死无对证，因此坚定了信念，一口咬定宋谦供他是因为他不接待而遭到的巫陷，要求对质。傅山在狱中绝食九日，几死，以此捍卫自己的尊严。

由于取不到主证、旁证的质对，加之在关键时刻山西布政使魏一鳌和山西按察使杨思圣等地方官员证明他们在请傅山看病时，遇见傅山曾坚决拒绝会见宋谦，所以最后在清廷上下汉族官员的帮助下，最终被无罪释放。