机械电子工程学科是全国首批博士学位授予点和博士后流动站。 1988 年批准为首批国家重点学科。建有流体传动及控制国家重点实验室和电液控制国家工程技术研究中心。

该学科拥有一支以两院院士为学术带头人，精干、高层次、年轻化的学术队伍。现有两院院士 1 人， 45 岁以下教授、副教授 22 人，具有博士学位教师 24 人；在校博士后、博士生、硕士生近二百人。拥有国内该学科唯一的五年制本科专业。

多年来，该学科在机械电子控制工程领域形成独有特色和优势。其主要研究方向为电液控制技术、机电控制及自动化、现代气动技术、应用流体力学、计算机应用及智能系统，取得省部级以上科研奖 60 多项，其中国家级奖 3 项；获专利 57 项，其中发明专利 17 项；获国家教学成果奖 1 项。学科处于流体传动及控制领域世界著名学术机构前五位。已主办五次该领域最具影响的杭州流体动力国际学术会议（四年一届）。