杨琛,女,博士,
中国科学院上海生命科学研究院研究员。在国内外发表论文20余篇(包括J. Bacteriol., J. Biol. Chem., Appl. Environ. Microbiol., Biotechnol. Bioeng.等国际重要刊物)。
人物经历
1994年 毕业于浙江大学化学工程系生物化学工程专业;
2001年 获
日本九州工业大学生物科学和生物信息学系博士学位;
2001至2004年 日本庆应大学先端生命科学研究所 博士后;
2004至2008年 美国Burnham医学研究所 博士后;
2008年入选中国科学院先进工业生物技术创新基地“百人计划”。
已在国内外发表论文50余篇(包括Mol. Microbiol., J. Biol. Chem., J. Bacteriol., PNAS等国际重要刊物)。
社会任职
上海市徐汇区第十五届人大代表。
研究工作
致力于开发代谢途径设计及网络调试平台,发展代谢流量组和代谢组分析技术、以及代谢途径和转录
调控网络的
比较基因组学重构技术等;研究重要模式及工业微生物
代谢网络及其调控的分子机制,揭示各种调节机制的相互作用及对代谢流量的调控机理,为合理改造细胞代谢、优化微生物生产提供理论依据;并开展光合微生物的代谢工程与
合成生物学研究,通过对结构元件和调控元件的功能优化及设计组装,实现目标化合物的优化生产。
人物荣誉
2019年8月2日,入选2019年度
国家杰出青年科学基金建议资助项目申请人名单。
近期论文
1. Xiaoqun Nie,‡ Bin Yang,‡ Lei Zhang, Yang Gu, Sheng Yang, Weihong Jiang, Chen Yang*. (2016) PTS regulation domain-containing transcriptional activator CelR and sigma factor σ54 control cellobiose utilization in Clostridium acetobutylicum. Molecular Microbiology, in press.
2. Deng Liu and Chen Yang* (2014) The nitrogen-regulated response regulator NrrA controls cyanophycin synthesis and glycogen catabolism in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. Journal of Biological Chemistry 289: 2055-2071
3. Lei Zhang, Xiaoqun Nie, Dmitry Ravcheev, Dmitry Rodionov, Jia Sheng, Yang Gu, Sheng Yang, Weihong Jiang, Chen Yang* (2014) Redox-responsive repressor Rex modulates alcohol production and oxidative stress tolerance in Clostridium acetobutylicum. Journal of Bacteriology 196(22): 3949-3963
4. Dongfeng Liu, Guomin Ai, Qingxiang Zheng, Chang Liu, Chengying Jiang, Lixia Liu, Bo Zhang, Yiming Liu, Chen Yang*, Shuangjiang Liu* (2014) Metabolic flux responses to genetic modification for shikimic acid production by Bacillus subtilis strains. Microbial Cell Factory 13(1): 40
5. Yongzhen Tao, Deng Liu, Xing Yang, Zhihua Zhou, Jeong K. Lee, Chen Yang* (2012) Network identification and flux quantification of glucose metabolism in Rhodobacter sphaeroides under photoheterotrophic H2-producing conditions. Journal of Bacteriology 194(2): 274-283.
6. Lei Zhang, Semen A. Leyn, Yang Gu, Weihong Jiang, Dmitry A. Rodionov*, Chen Yang* (2012) Ribulokinase and transcriptional regulation of arabinose metabolism in Clostridium acetobutylicum. Journal of Bacteriology 194(5): 1055-1064.
7. Lixia Liu, Lei Zhang, Wei Tang, Yang Gu, Qiang Hua, Sheng Yang, Weihong Jiang, Chen Yang* (2012) Phosphoketolase pathway for xylose catabolism in Clostridium acetobutylicum revealed by 13C metabolic flux analysis. Journal of Bacteriology 194(19): 5413-5422.
8. Semen A. Leyn, Fang Gao, Chen Yang*, Dmitry A. Rodionov* (2012) N-Acetylgalactosamine utilization pathway and regulon in proteobacteria. Genomic reconstruction and experimental characterization in Shewanella. Journal of Biological Chemistry 287(33): 28047-56.
9. Yang Gu, Yi Ding, Cong Ren, Zhe Sun, Dmitry A. Rodionov, Weiwen Zhang, Sheng Yang, Chen Yang*, Weihong Jiang* (2010) Reconstruction of xylose utilization pathway and regulons in Firmicutes. BMC Genomics 11: 255.