桂林市农业科学院位于桂林市南郊雁山区雁山镇，1955年建立的桂林农业试验站，主要开展种植业基础应用研究和应用研究，重点是粮、油、果、菜等作物优良新品种选育及其栽培、肥水统筹、植保等配套新技术研究。

1955年，桂林农业试验站建立。1972年9月，更名为桂林地区农业科学研究所。

1998年，更名为桂林市农业科学研究所。2009年9月，成立广西农业科学院桂北分院。

2014年4月，更名为桂林市农业科学院。

据2018年4月官网资料显示，农科院共有职工199人：在职人员85人，其中正高职称1人，副高职称4人，中初级职称55人；退休人员112人。构建了水稻、玉米、油菜、果树、薯类、甘蔗、果蔬、桑蚕等8个学术团队。

据2018年4月官网资料显示，农科院内设粮食与油料作物研究所、园艺作物研究所、经济作物研究所、蚕业技术研究所。

农科院建有国家农作物品种区域试验站、国家产业技术体系（油菜、木薯、甘蔗）桂林综合试验站等4个国家级试验站；国家现代农业产业技术体系广西创新团队（水稻、玉米、桑蚕）桂林综合试验站等3个自治区级试验站。

农科院建有广西水稻良种培育中心（桂林）、广西葡萄良种培育中心（桂林）、桂林市柑桔无病毒苗木繁育中心、桂林市葡萄工程技术研究中心、桂林葡萄产业技术创新战略联盟、桂中北水稻选育工程技术研究中心、广西重点区域蚕种场等科研平台。

依托农科院的科研平台成立桂林生态农业人才小高地、广西大学桂林甘蔗农科教合作人才培养基地、与广西蚕业科学研究院共建广西蚕业科学研究院桂林分院。

据2018年4月官网资料显示，“十二五”以来，农科院共获得科研成果奖11项，其中获得桂林市科学技术进步二等奖1项、三等奖4项，获得广西农业科学院科学进步一等奖1项、二等奖3项、三等奖2项；科技厅成果登记4项；编制广西地方标准一项，该标准于2013年被广西壮族自治区质量技术监督局颁布实施；发表论文27篇，合著专著1部，其中获桂林市自然科学优秀论文奖二等奖1项、三等奖1项。