梁园区卫生局是主管全区卫生工作的政府部门，是卫生法律法规的执法主体，正科级。

梁园区卫生局内设18个科室，分别是办公室、党办、农合办、医政科、财务科、人事科、疾控科、基妇科、执法科、中医科、应急办、招商办、监察室、老干部科、科教科、红十字会、地病办、艾防办等。所辖医疗卫生机构26个，分别是商丘市第三人民医院、商丘市长征人民医院、商丘市妇幼保健院、梁园区中医院、梁园区防疫站、梁园区卫生监督所、梁园区执法大队、梁园区医学会、商丘卫生中等专业学校，八八、前进、东风三个社区服务中心和14所乡镇卫生院。