梅河口市地方税务局现内设办公室、政策法规科、计划财务科等12个科室，下设税源管理一科、税源管理二科，税源管理三科，税源管理四科4个科室，红梅分局、山城分局、海龙分局3个派出机构，现有干部职工174人。

1、办公室：负责全局日常政务性工作，制定行政管理的各项规章制度。负责全局公文处理、机关文书档案、信息及新闻宣传、保密和督查督办工作；负责文字综合材料及重要文件的起草、审核工作；负责会务管理、办公用品管理、印信管理、信访舆情应急管理，承担税收宣传、政务公开及内网网站管理工作。

2、政策法规科：负责拟订依法行政工作方案并组织实施；参与起草有关规范性文件；组织协调涉及多税种、综合性税收政策文件的起草和贯彻落实工作；承办较大税收案件的审理工作和行政处罚监督指导工作；承担本系统有关规范性文件的合法性审核和备案备查工作；组织有关规范性文件的清理、评估、反馈和汇编工作；承担减免税、退税业务的审核；承办税务行政复议、行政诉讼工作；承担本部门职责范围内风险管理及特殊事项专业化应对等工作。负责流转税、所得税、财产与行为税的上级对口工作。

3、计划财务科：负责汇总分析全市地方税收会计、统计信息数据，组织办理并检查税款入、退库，负责税收收入数据的录入、核算、统计、分析和预测，负责管理税收票证；负责财务、经费、装备、固定资产和专项资金的管理和内部审计工作。

4、征管和科技发展科：组织落实综合性税收征管法律、法规、部门规章及规范性文件，拟订具体操作办法；研究制定税收征管规程；组织协调综合治税工作；组织税务登记、纳税申报、欠税管理、发票管理和税收征管档案工作；承担征管质量考核工作；代收费管理、委托代征管理等工作；承担跨区域交叉税户管辖机关维护；承担总省、省局确定的大企业管理工作；承担外资企业年检工作；承担与国税、工商、银行等部门的协调工作；承担本部门职责范围内风险管理、信息管税及特殊事项专业化应对等其他与税收征管有关的工作。

5.风险评估科：负责梅河口市地方税务局和梅河口经济开发区地方税务局税收风险评估管理工作的规划、组织和协调，制定相关管理办法和制度，明确岗位职责分工和工作流程；负责税收风险识别模型建设和维护，风险归集、风险识别、风险等级排序、风险推送、风险应对结果考评等工作；负责纳税评估工作的组织协调和业务指导；牵头制定涉税数据管理办法和数据审计管理办法；承担数据标准化和质量管理，涉税数据信息采集、交换、加工、分析、提供、推送和查询服务等工作；承担对涉税信息应用状况的测评和跟踪反馈工作。负责制定税收计划和税源管理工作。

6、人事教育科：负责全局的干部人事、劳动工资、机构编制等工作；负责离退休干部管理工作；负责绩效管理、教育培训、基层分局规范化建设、干部职工队伍建设工作。

7、监察室：负责全市地税系统党风廉政建设和反腐败工作；负责地税系统领导干部和基层领导班子及干部廉洁自律；负责地税系统政行风行和软环境建设，落实“两权”监督，从源头上预防和治理腐败，负责违法违纪案件查处和责任追究工作。负责组织实施税收法律法规、部门规章及规范性文件执行情况的监督检查；负责内部财务审计，负责财政、审计部门税收财务检查工作的衔接和相关问题整改。

8、党办：负责全局党团群工作；负责完成与地方政府各部委衔接的各项工作，包括创建精神文明先进单位、巾帼文明岗、青年文明岗等争先创优工作以及与之相对应的上级局主管的各项工作。

9、工会：负责制定工会年度工作计划，组织实施并检查落实，负责指导和维护职工的合法权益，反映基层工会和群众的意见和要求，指导组织职工参与民主管理和监督，适时组织开展政治性强、参与面广、丰富多彩、健康活泼的文化体育活动。

10、税收研究会：负责国际税收研究会日常事务管理、协调工作，按照上级要求制定全局年度调研课题，并组织开展调研活动、撰写调研文章。

11.机关服务中心：负责公务接待服务工作，负责全系统四防安全监督、指导、考核，重大安全事故信息收集、上报工作；重大行政事项请示、报告工作；负责食堂餐饮、客房管理等工作。

12、电子税务管理中心（信息中心）：负责计算机网络日常维护和数据管理；负责计算机系统安全管理；负责征管信息软件及计算机相关技术推广应用中的培训指导等工作。

2017年11月，获得中央精神文明建设指导委员会授予的“第五届全国文明单位”荣誉称号。