寺庙背靠瞻巴拉山，面对象山和大渡河支流则曲河。眺望象山伸出长鼻畅饮则曲渡河水，把河流弯曲成“U”字形，妙不可言。瞻巴拉山像一尊神佛塑像巍然屹立，著名的佛教密宗修行圣地密咒修行洞、仙人洞、格萨尔修行洞、喜瓦拉传承修行洞，吉祥八宝物、转王七宝分布其中。传说公元前4世纪印度的一位圣人跋山涉水来到这里修行成佛。
寺院总占地1.023公顷，建筑面积1538平方米。该寺共有喇嘛塔32座，分别为明、清、民国时期陆续修建，分布在寺院中部长465米、宽25米的范围内，在历史上与西藏的降扎寺、甘孜色达寺塔群并称全国藏区3大塔群。塔均为堵波式正方形塔基，瓶肚形塔身，十三轮塔刹。
塔身内空，塔内供有
千手千眼佛、释伽佛、
无量寿佛、莲花生、佛母、绿度母等塑像及大量精美壁画。其中降妖塔建于1427年，塔基边长9.25米，塔体通高32米，内存部分明代佛像和壁画，是塔群中历史最悠久的喇嘛塔。
石刻
藏文大藏经刻于明清时期，分《甘珠儿》和《丹珠儿》2部，用50余万片石双面刻成，依照经文顺序堆放，占地620平方米，高11米。是藏区最完整的石刻藏经，也是全国数量最多的石刻藏经堆，在藏区信教群众中有极为深远的影响。 2001年，棒托寺被国务院公布为第五批全国重点文物保护单位。
据史料记载，石刻大藏经从明正统年始由60余名石匠辛勤镌刻达9年而成，大藏经高9.7米、长46米、宽13米，占地598平方米，是国内外稀有的石刻佛堂和藏学经典，也是最完整的一部石刻大藏经，具有极高的文物和艺术研究价值。
石刻大藏经周围以500年历史的降魔塔为中心，点缀着“万佛塔”、“尊胜塔”、“菩提塔”、“胜乐塔”、“多闻塔”、“仙人塔”、“长寿塔”、“时轮塔”、“伏魔塔”等32座塔，有的塔高达42米，有的则只有6米高，高低大小形状各异的塔错落其间。塔内塑有释迦牟尼、观世音等几千尊菩萨，绘有几万幅各种佛像画，尊尊形象逼真，栩栩如生。
塔林东侧有一菩提小塔，高6米，塔基周长12米，距今已有200多年的历史。据该寺的活佛介绍，每逢吉日或藏历十、十五日，塔内会传出朗朗的诵经声和各种美妙的法器声。因此，僧侣、香客择时前去聆听，人人以闻为荣。
历史悠久的棒托寺以其壮丽的庙宇、稀世的石刻大藏经、壮观的塔群及周围秀美的山水傲居于
青藏高原一隅，是藏文化的一朵奇葩。