当基因的活性对特定条件下细胞生长是必需时,含有该基因的细胞就可被筛选出来。如抗生素耐药性基因就可用以进行正向选择。 正向选择载体的设计则是使只有携带了插入的外源DNA的细胞才能在一定条件下幸存。如某些正向选择载体,含有对宿主致死的限制性内切酶基因或噬菌体溶菌基因,只有在这些基因中插入外源DNA使其失活,宿主才能生存。结果在基因克隆中凡能幸存的克隆,都含有DNA插入片段,从而达到选择的目的。

物种受外界环境的影响，进行基因的自我调节和转变，淘汰不适应环境的基因，产生可有效适应环境的基因。

2022年11月，中国科学家研究发现，在西瓜驯化过程中单、双糖（甜味）和类胡萝卜素（色泽）被正向选择。