武汉大学中国三至九世纪研究所由著名历史学家唐长孺教授（1911-1994）亲自组建并创办，前身为1961年创立的魏晋南北朝隋唐史研究室，1980年经教育部（时为国家教委）批准正式建所（84教高一字007号）。1981年，成为国家授予的首批中国古代史博士点之一，1988年，又经教育部批准为国家重点学科。

武汉大学中国三至九世纪研究所的缔造者唐长孺教授，早年从事辽、金、元史的研究，其后转入魏晋南北朝隋唐史研究领域，先后撰著并出版了《魏晋南北朝史论丛》、《魏晋南北朝史论丛续编》、《三至六世纪江南大土地所有制的发展》、《魏晋南北朝史论拾遗》、《唐书兵志笺正》、《山居存稿》、《魏晋南北朝隋唐史三论》等重要学术论著，其学术结论广为国内外学术界所称引，蜚声于国际史坛，为武大中国古代史学科的创立、建设与发展做出了突出的贡献。

本所继承和发扬唐长孺先生等老一辈学者所倡导的优良学风，严谨踏实，开拓创新，早已形成三个稳定的研究方向：魏晋南北朝史、隋唐五代史、敦煌吐鲁番文书整理与研究。在学术研究、人才培养、对外交流等方面，成就卓著，陆续向学术界推出了一批厚重扎实的高水平研究成果（详后），屡获国家相关人文社科成果奖大奖（详后）；又以基本每年一辑的学术年刊《魏晋南北朝隋唐史资料》（已出至四十一辑，2005年、2007年成功入选CSSCI学术集刊刊源），向学术界展示本所同仁的最新研究成果。学术成果受到国内外史学界高度关注，被史学界誉为国内外中国中古史研究的重镇之一。

曾经在本所工作过的学者有陈仲安教授（1922-1993）、黄惠贤教授、陈国灿教授、卢开万教授、杨德炳教授、鲁才全教授、朱雷教授、牟发松教授 、孙继民教授等，在职的学者有冻国栋教授（所长）、何德章教授、刘安志教授、朱海副教授、魏斌副教授等。

1.马克思主义理论研究和建设工程编撰《中国古代史》教材，马克思主义理论研究和建设工程（教育部）第一批高等学校哲学社会科学重点编写教材《中国古代史》项目（视同教育部重大攻关项目），冻国栋教授为第二首席专家，何德章教授、刘安志教授为分编负责人；魏斌、朱海副教授为成员。本所承担第二编“民族融合与隋唐国家的重建”部分的编撰任务。经费尚未拨付。

2.“敦煌官文书与唐五代地方政治制度研究”，教育部人文社会科学重点研究基地重大项目，兰州大学齐陈骏教授主持，刘安志教授主要参与。

3.“点校本“北朝四史”（《北史》、《魏书》、《北齐书》、《周书》）修订”，国家“点校本二十四史暨《清史稿》修订工程”工作委员会、教育部社科基金委托项目，朱雷教授、冻国栋教授主持。

4.“六朝时期江南腹地社会与中央政权的关系”，国家社科基金青年项目，魏斌副教授承担。

5.“晋唐时期农民问题与乡村社会变迁综合研究”，国家社科基金项目，冻国栋教授主持。

1.《敦煌吐鲁番文书初探》（一二编），获首届国家教委全国高等学校人文社会科学研究优秀成果奖一等奖，1995年12月；获湖北省首届社会科学优秀成果省级（著作类）荣誉奖，1995年6月。

2.《魏晋南北朝隋唐史三论》，获首届国家教委全国高等学校人文社会科学研究优秀成果奖一等奖，1995年12月；获第二届国家图书奖提名奖，1995年12月；获国家教委第二届全国高等学校出版社优秀学术著作奖特等奖，1995年11月。

3.《唐代人口问题研究》，获湖北省人文社科优秀成果奖（政府奖）三等奖，1995年。

4.《斯坦因所获吐鲁番文书研究》，获教育部第二届人文社会科学研究成果奖二等奖，1998年12月。

5.《吐鲁番出土文书》（1-4卷），获国家社科基金项目优秀成果奖一等奖，1999年9月；获第三届国家图书奖提名奖，1997年8月。

6.《中国政治制度通史》（10卷，白钢主编，本所黄惠贤教授撰写第四卷，排名第三），获国家社科基金项目优秀成果奖一等奖，1999年9月；获第三届国家图书奖，1997年8月。

7.《敦煌吐鲁番文书论丛》，获教育部第三届中国高校人文社会科学优秀成果奖二等奖，2003年7月。

8.《日本宁乐美术馆藏吐鲁番文书》，获湖北省第三届人文社会科学优秀成果奖三等奖，2001年1月。

9.《中国人口史·隋唐五代时期》，湖北省第四届人文社会科学研究优秀成果奖三等奖，2004年10月。

10.《中国人口史》（1-6卷，葛剑雄主编，冻国栋教授撰写第二卷，排名第二），第四届中国高校人文社会科学优秀成果一等奖，2006年12月；首届中国出版政府奖提名奖，2007年11月。

11.《中国中古经济与社会史论丛》，获武汉大学第十一届人文社科研究优秀成果一等奖 ，2007年12月。

12.《唐代安西都护府对龟兹的治理》（论文），获武汉大学第十一届人文社科研究优秀成果二等奖 ，2007年12月。

13.《唐代大赦行政职能研究》（系列论文），获武汉大学第十一届人文社科研究优秀成果二等奖 ，2007年12月。