武汉马应龙大药房连锁有限公司成立于2000年，注册资金5470万元，是武汉马应龙药业集团股份有限公司的控股子公司之一。

公司将发展和扩张作为资本经营的方向，七年多来，通过资产重组、收购兼并、控股经营和企业联盟等多种方式谋求与药品经营企业多种形式的合作，不断扩大连锁经营的规模，目前已成长为一家拥有69家连锁药店、物流通畅、信息灵敏、设施完备、管理规范的现代药品零售企业，经营范围涵盖中西成药、中药材、中药饮片、保健食品、计生用品、医疗器械、日用化学品、纺织品、百货零售兼批发等。截至 2006 年 12 月 31 日，武汉马应龙大药房连锁有限公司经审计后的资产总额已达到103,107,259.39元，净资产57,895,571.67元，2006年实现净利润3,156,779.68元。

悠久的历史沉淀，现代化的管理运作，马应龙大药房把两者完美地融合在一起，在市场营销及员工发展等多方面全面注入现代企业管理理念，在经营过程中充分强调市场观念、服务观念、效益观念及竞争观念，不断完善业务流程和质量管理规范。突出服务质量和服务特色，按照“统一标识、统一采购配送、统一核算、统一管理、统一服务标准，实现资源配置最优化、连锁网络规模化、经营运作规范化”的原则运作。优质的商品和良好的服务吸引了近40万人成为马应龙大药房的忠实会员。2002年，在湖北省药品零售行业内，马应龙大药房率先通过国家食品药品监督管理局组织的GSP认证，历年来市场抽检的合格率均达到100%。

秉承“诚信专业、健康大众”的企业理念，马应龙大药房塑造出“美丽健康药房”的品牌形象，并由此获得了“药品规范管理先进单位”、“质量管理优胜单位”、“价格统计先进单位”、“消费者满意单位”、“湖北省分行业十强企业”等一系列荣誉，旗下的门店又在最近获得了“文明窗口示范岗”的光荣称号。

2007年8月，马应龙正式与汉深达成股权合作协议。马应龙出资3000万元，拿下汉深54%的控股权

2007年11月，马应龙再以700万元的价格，收购中商平价旗下中南爱欣大药房78%的股权，中商平价仍持股22%。

2008年出资3269 万元受让上海复星药业有限公司所持主营药品批发及终端配送业务的湖北天下明药业有限公司51%的股权

2010年,马应龙投资3000万元,组建网上药店事业部，从事药品网络零售业务。同年10月，获得湖北省首张《互联网药品信息服务资格证书》。从此打破湖北省没有一家合法网上药店的局面。