1994年,执导个人首部纪录片《
广场》,该片获得山形国际纪录片电影节“国际影评人协会”奖、波波里国际纪录片电影节最佳人文影片奖。
1997年,执导的纪录片《
八廓南街16号》在法国真实电影节上映,该片记录了位于拉萨廓南街16号的居委会的日常工作,获得法国真实电影节大奖“真实电影奖”;同年,执导纪录片《天边》。
2002年,执导纪录片《爱情战争》;同年,担任纪录片《
拎起大舌头》的导演。
2005年,执导纪录片《
粉墨春秋》,该片从京剧的起源、发展,到京剧名角、名曲的成名、流传等角度,以图像与采访、讲述相结合,以全景姿态展现京剧发展的历史脉络。
2009年,与
康健宁、
蒋樾联合执导纪录片《法门寺》,该片将法门寺放到了佛教东传的千年历程中予以考察,再现了佛教的文明奇迹。
在纪录片《广场》和《八廓南街16号》中,充分展示了段锦川对生活的把握能力。他喜欢拍摄事件,这里重要的不是某个人物,而是人物置身其间的环境;但他只拍公共空间,不涉及私秘性。他采用的是一种旁观的方式,也就是在摄影机与被拍摄者之间保持一定的距离,争取把摄影机对被拍摄者的影响降到最低,尽量真实地表现人物与事件的本来面目,首先从技术的角度就尽力避免表露作者的感情色彩和道德取向。这种冷静的拍摄方式让他能“复杂地表现复杂的生活”,展现生活中的各个侧面。可以说他的几部成熟的纪录片是肇始于二十世纪六十年代的“直接电影”在中国的成熟的操练。而这种方式并不意味着他的纪录片不强调戏剧性,相反,段锦川在他所观察的生活中总是尽量寻找戏剧性元素(网易娱乐评)。