水平基因的转移，主要发生在微生物中，常常是由质粒介导，是仅次于基因垂直传递重要的基因交流。

定义

基因水平转移（Horizontal gene transfer，HGT），又称水平基因转移或基因侧向转移（lateral gene transfer，LGT），指生物将遗传物质传递给其他细胞而非其子代的过程，例如：接合（conjugation）、转导（transduction）、转化（transformation）与此相对，“基因垂直转移”指生物由其祖先继承遗传物质。遗传学一般关心更为普遍的垂直传递，但知识表明，基因水平转移是一个重要的现象。由于此现象的存在，使生物早期的演化关系更为复杂。

人工的基因水平转移属于基因工程的一种。