为适应江苏教育现代化的需要，建设一支符合素质教育要求的高质量的教师队伍，进一步加强全省教师培训的统筹与管理，提高教育培训的质量与效益，1999年9月9日，江苏省教育委员会（现江苏教育厅）下发了《关于在南京师范大学附属幼儿师范学校增挂江苏省教育培训中心牌子的决定》（苏教人〔1999〕70号），江苏省教师培训中心正式成立。
为保证全省各级各类学校教师资格认定工作的正常开展，推动教师资格制度的有效实施，2002年12月20日
江苏省教育厅发出《关于江苏省教师培训中心增挂江苏省教师资格认定指导中心牌子的通知》（苏教人〔2002〕161号），决定在江苏省教师培训中心增挂江苏省教师资格认定指导中心的牌子，并设办公室，配备2－3名工作人员，在厅师资处指导下，负责教师资格认定工作的政策咨询、信息服务、证书管理和人员培训等具体工作。
2005年8月25日，
江苏省教育厅再次下发《关于省教师培训中心体制调整有关问题的通知》（苏教人〔2005〕55号），决定将“省教师培训中心”成建制并入
江苏教育学院（
江苏省教育科学研究院）。江苏省教师培训中心原承担的相关职能由江苏教育学院（江苏省教育科学研究院）承担，其编制在内的在职人员随机构并入。2006年2月27日，江苏教育学院（江苏省教育科学研究院）正式将成立于1992年2月17日的原江苏省中学教师培训中心与成建刚并入的江苏省教师培训中心重新进行整合。2006年3月14日，新近组建的“江苏省教师培训中心”正式揭牌。