江西省棉花研究所（Jiangxi Province Cotton Research Institute）系原江西省农业厅直属的全民事业单位，为江西省唯一省级（正处级）棉花专业研究所。
历史沿革
1973年8月，经江西省人民政府批准成立江西省棉花试验站，隶属省农业局和当地党委双重领导。
1975年12月，更名为“江西省农科院棉花研究所”，隶属省农业局。
1988年，更名为“江西省棉花研究所”，隶属省农业厅。
2007年12月，经农业部批准增挂“国家棉花产业技术体系鄱阳湖综合试验站”。
科研条件
人员编制
截至2015年5月，研究所辖区共有人口2200人，住户698户。
研究所共有在职职工314人，在职各类技术人员73人（正高级2人、副高级10人、中级19人），有硕士学历10人。聘请喻树迅院士为科研首席科学家。
研究所共有在职科研人员32人。其中正高职称2人，副高职称8人，硕士学历10人，在读博士2人，在读硕士2人。
科研部门
截至2015年5月，研究所设有九江县国家级农作物品种区域试验站（2001年）、国家棉花产业技术体系鄱阳湖综合试验站（2007年）、中国农科院棉花研究所鄱阳湖生态育种试验站（2008年，合作研究）、中国农科院科技创新工程“轻简化植棉”团队（2015年），建有江西省棉花院士工作室、江西省棉花遗传育种重点实验室以及育种研究室、栽培研究室、植保研究室、区试研究室、品种资源研究室等科研部门，研究所积极申报江西省棉花工程技术中心。
硬件设施
截至2015年5月，研究所建有生理生化、土壤分析、棉虫观测、病菌培养、纤维测定、种子检验等实验室，投资近200万元组建分子遗传实验室。
研究所建有棉花试验基地4个共360亩，建有标准化的抗病鉴定圃5亩。
研究所在江西省6个主要植棉县建设了11个科技示范基地共计1470亩。
科研成就
科研成果
截至2015年5月，研究所先后选育出赣棉5号、赣棉6号、赣棉8号、赣棉11号、赣棉13号、赣47系、赣棉杂1号、赣杂106、赣杂108、赣杂棉3号、赣棉杂11号、赣棉杂109、赣棉杂GZ8、赣杂棉800、赣棉杂0906等15个棉花新品种；共承担国家、省级等各类科研项目近500项，获经费资助2000万元以上；获各类科研成果及奖励60余项；累计申请获得专利15项，获批10项；制定并发布地方标准10项。
2014年，研究所承担了各类项目20项，开展81个试验。发表论文36篇，主编著作1部、参编著作2部。2项成果通过鉴定，申报了3项成果奖，2个项目通过专家田间测产验收。2个品种通过审定。推荐了11个棉花新组合（品系）参加省级棉花新品种区域试验。报了2个专利、获授权专利1个。2个项目获省科技项目立项，申报2015年科技项目6个。
研究所先后荣获国家科委科技进步一等奖1项、农业部科技进步一等奖1项、农业部农牧渔业丰收奖3项、省政府科技进步奖二等奖3项和三等奖9项、省政府优秀成果四等奖3项、省科委情报调研二等奖1项、省农科院优秀成果三等奖2项、地市级技术改进二等奖7项和三等奖3项、其他行业性奖类8项。
学术刊物
《棉花科学》，1979年创刊，时名《江西棉花科学通讯》，1983年3月，经批准更名为《江西棉花》，经国家科委核准，1993年，《江西棉花》由内刊转为公开发行的正式期刊。
《棉花科学》为专业学术期刊，每年出版6期，设有专题综述、试验研究、高产高效、棉业调研、产业之路、轻简栽培、减灾技术、质量检验等栏目。
2010年获江西省优秀科技期刊奖。2014年获优秀主编奖。国家新闻出版总署收录，国家图书馆维普网、万方数据库、知网数据库全文收录。
文化传统
研究所所徽的主体为一朵棉花，突显了研究所是从事棉花研究的机构，棉花内的“JXCRI”为研究所英文名称的缩写。
机构领导
党委书记：余进祥
党委委员、副所长：鲁速明、柯兴盛、杨磊、朱模勇
党委委员、纪委书记：聂太礼