1978 以来在心理系从事生理心理学教学和研究。从1986年北京大学跨学科的第一个国家重点实验室（视觉听觉信息处理国家重点实验室）建立起，一直承担该实验室的跨学科研究工作。

沈政在北大20年来，总是紧跟国际学术的最新发展潮流，不断扩展新知识，坚持跨学科的高新理论与技术研究，1993年获北京大学自然科学研究成果二等奖。先后在心理学系和信息中心讲授“脑与计算机”、“认知神经科学”、“人工智能”等新课程。指导研究生从事跨学科的基础理论研究工作。承担多项国家重大和重点项目的研究工作，开展关于知觉、记忆的多层次脑功能研究工作。