洲子尾沟位于台湾省北部，为淡水河的支流，流域分布于台北县五股乡、芦洲市、三重市。其源头位于三重市，向北流至芦洲市边界处转西北，随后沿芦洲与五股边界绕行，至芦洲西北角纳入东南方流来之支流水湳沟，随即向西北注入淡水河。

洲子尾沟原本注入淡水河的另一支流塭子川，后因拓宽淡水河道工程而炸毁狮子头隘口，即变成现况之各自注入淡水河。

洲子尾沟流域地势低平，以往每遇大雨，中、下游地区排水困难，极易积水为患。二重疏洪道兴建后，下游河道已纳入疏洪道内，而以鸭母港沟抽水站控制排放水。