学院前身为创建于1977年的舟山师范专科学校物理系、数学系和成立于1958年的原浙江水产学院基础课部的部分教研室，2000年9月更名为信息学院，2006年7月更名为数理与信息学院，2020更名为信息工程学院。
设有数学与应用数学（师范类）、物理学（师范类）、计算机科学与技术、数据科学与大数据技术、电子信息工程、机器人、信息与计算科学七个本科专业，其中数学与应用数学为浙江省重点建设专业。学院有数学、物理学、计算机科学与技术、电子信息工程四个学科，其中数学学科为浙江省一流学科B类。学院拥有数学一级学科学术硕士点和农业硕士农业工程与信息技术领域农业信息化方向专业学位硕士点。
学院共有教职工92人，其中专任教师68人（包括双肩挑、实验教师），博士学位42人，在读博士3人，专任教师博士学位比例为65%。专任教师中有海外留学6个月以上经历的11人，境外获得博士学位4人；专任教师中具有高级职称教师的有35人,占58%（其中教授12人，占20%），硕士研究生导师20人，兼职博士研究生导师1人。国务院特殊津贴获得者1人，高被引学者1人，浙江省级人才2人，浙江省高校中青年学科带头人2人，浙江省“151”人才5人，浙江省教坛新秀1人。
学院坚持“以生为本”和“以师为尊”的原则，重视学生专业指导，重视学生科技创新和科研能力培育，鼓励学生积极参加学科竞赛。形成了“日思日睿，笃志笃行”大学生文明修身和“自主学习，砺学砺行”学风建设两大品牌活动，毕业生就业率年均达到95%以上，2020届毕业生考研升学率达到30.39%。
学院拥有浙江省海洋大数据挖掘与应用重点实验室和舟山市海视通电子科技产品研发中心等科研平台。学院科研，每年承担国家级和省部级项目十余项，到校科研经费数百万元，是学校三大检索论文的重要产出单位。曾获国家科学技术进步奖二等奖、教育部科学技术进步奖一等奖以及浙江省科学技术奖二等奖等一系列奖项。
学院拥有丰富的教学平台，包括计算机专业实验室、
近代物理实验室、数学综合实验室、电信专业实验室4个专业教学实验室和公共物理实验教学中心、公共计算机中心2个面向全校的公共实验平台。
学院积极拓展对外合作交流，与杭州湾信息港高新建设开发有限公司，杭州下沙第一小学，南海实验学校、舟山市第一初级中学等30多个单位建立教学实践、就业实习见习基地；学生每年都有到俄罗斯南乌拉尔国立大学、韩国釜庆国立大学、河北师范大学、浙江师范大学等国内外高校进行访学。