日本海上自卫队干部学校是日本自卫队培训海上自卫队中、高级指挥官及高级参谋人员的学校，是海上自卫队的最高军事学府。该校成立于1954年9月1日．最初设在横须贺市的田浦，后迁至东京都小平市，1959年2月迁至现址东京都新宿区市谷。

该校设校长、副校长各1人，校长开始由海将补衔军官担任，1956年改由海将衔军官担任。学校下设分别担负教育训练和调查研究的教育部、研究部。此外，还有负责管理和后勤保障的总务处和教务处，还有资料处。该校主要任务是使学员掌握作为海上自卫队中、高级指挥官及参谋人员应具备的知识与技能。

该校是日本海上自卫队军官晋升为高级军官的必由之路，每年报考人数较多，竞争激烈，录取率为20：1。军官高级班的本科生经两次考试后由海上幕僚长选定；军官特别班学员直接由海上幕僚长选拔；指挥参谋班学员由日本海上自卫队各部队、机关选拔，经统一考试后，方由海上幕僚监部下令调学。

学校设有指挥参谋课程，培养一等海尉和三等海佐军官(34～37岁)，每期约招收30名，学制1年；军官高级课程，主要培训二等海佐军官(41～45岁)，每期约招收20名，学制1年；军官特别课程，培训一等海佐军官或少数二等海佐军官(45～47岁)，学制1年。此外，还对未学过联合参谋学校课程和海上自卫队干部学校各课程的二等海佐、三等海佐和有发展前途的一等海尉军官、6级以上的文职事务官等进行战史、后勤和国际法函授教育，学制8～9个月，每一科目约招收50名学员。函授学员毕业后，将在各个部门继续自学，进一步提高业务水平。此外，该校还对海上自卫队大部队的运用进行调查研究。

鉴于复杂的国际形势变化，需要培养一批除本军种外也能了解掌握其他军种防卫战略、战术，视野开阔的军事人才，以适应日趋增多的维和任务的需要，1997年3月，海上自卫队干部学校开始招收航空和陆上自卫队学员入学，学习指挥参谋课程和高级军官课程。同时，也派出人员到航空和陆上自卫队院校学习。