《海军医学杂志》创刊于1980年，是由中国人民解放军海军后勤保障部卫生局主管、中国人民解放军海军医学研究所主办的医学类学术期刊。

1980年，《海军军事医学》创刊，为内部刊物。

1983年，《海军医学》创刊，为内部刊物。

1999年6月，经中华人民共和国原新闻出版总署批准，《海军医学》和《海军军事医学》合并为《海军医学杂志》，正式在中国国内外公开发行。

2011年，该刊刊期由季刊改为双月刊。

2014年2月，《海军医学杂志》在线稿件处理系统正式启用；同年11月，该刊正式推出微信公众号；同年12月，该刊成为中国原国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。

2022年经新闻出版总署批准，主管单位变更为海军军医大学，主办单位变更为海军特色医学中心，刊期由双月刊变更为月刊。

《海军医学杂志》主要栏目有军事医学、基础医学、临床医学、卫勤保障、调查报告、医院管理、护理园地、综述与讲座、病例报告等。

《海军医学杂志》主要刊登海军军事医学、预防医学以及海军特种作业环境医学研究的新技术、新成果；基础医学、临床医学、医学教学训练、卫生事业管理等方面的论著和经验交流；海军卫生工作经验及医疗卫生新技术；中国国内外海军医学研究新理论、新进展的综述与讲座等内容。

《海军医学杂志》读者对象为海军卫生系统的科研、教学人员、医务工作员和卫生管理人员，以及关心、支持海军卫生事业建设的海军内外人士。

据2020年3月《海军医学杂志》官网显示，《海军医学杂志》编委会有编委63人、顾问4人。

据2020年3月15日中国知网显示，《海军医学杂志》共出版文献7374篇。

据2020年3月15日万方数据知识服务平台显示，《海军医学杂志》共载文4662篇、基金论文量为403篇。

《海军医学杂志》是中国科技核心期刊、中国科技论文统计源期刊、中国学术期刊综合评价数据库来源期刊、中文生物医学期刊数据库（CMCC）统计源期刊，被中国知网、万方数据知识服务平台等数据库收录。

据2020年3月15日中国知网显示，《海军医学杂志》总被下载311292次、总被引13985次，（2019版）复合影响因子为0.683、（2019版）综合影响因子为0.622。

据2020年3月15日万方数据知识服务平台显示，《海军医学杂志》被引量为13326次、下载量为106488次；据2017年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，该刊影响因子为0.92（医学综合刊均影响因子为1.02），在全部统计源期刊（6670种）中排第1654名。

《海军医学杂志》曾获得全军优秀医学期刊奖、全军优秀编辑质量奖、上海市高校特色科技期刊、上海市高校最佳进步科技期刊奖，是Caj-cd规范获奖期刊。

《海军医学杂志》坚持突出姓军为海的特色。

1987年，在《海军医学》创刊5周年之际，原海军司令员肖劲光、刘华清，政委李耀文分别为杂志题词。

原海军司令员肖劲光——“发展海军医学”

原海军司令员刘华清——“普及医学知识、加强学术交流”

原海军政委李耀文——“为发展海军医学事业而努力”。

1、文题应简明、确切地反映文稿的特定内容，一般不超过20个汉字，不能使用非公认的缩略语、标点、疑问句式等。

2、作者必须同时具备以下条件：

（1）参与选题、设计、研究、观察，或参与资料的分析和解释者。

（2）起草或修改论文中关键性理论或主要内容者。

（3）能对编辑部的修改意见进行核修，在学术界进行答辩，并最终同意该文发表者。

作者中如有外籍人士，应征得其同意，并有证明信，文稿应标出全部作者的工作单位（写到科室），并列于文稿首页脚注位置，作者单位前同时标出所在省、城市、邮编，作者单位要求写全称，不得缩写；有部队代号的写部队代号，并在文后标出具体通讯地址。

3、摘要和关键词，论著的中、英文摘要均采用结构式书写方法,包括目的、方法、结果、结论，每篇论文均需标引3～5个关键词，且中、英文应一致。