海口港客运站位于海口市秀英码头，直属
海口港集团公司领导，是海南省的重要对外口岸和交通枢纽，素有海南大特区门户之称，担任着海口至海安、广州、北海、香港等4条海上客运航线的客运代理业务。
客运站设有旅客候船室和大型的客运售票中心，售票中心集售船票、火车票、汽车票、飞机票为一体，并在市内金亨酒店等地设有电脑联网船票发售点，方便旅客选择购票。客运站下设有艺星广告公司、免税店、贸易部、客运车队、行李托运室、大型停车场等，为旅客提供一条龙配套服务。
继1998年完成了电脑联网售票系统建立、
站前广场改造之后，2000年已投资600多万元改建一幢现代感强，设计简捷大方的客运大楼，该大楼分上下两层，总面积近5000平方米，内设普通候船区、贵宾候船区、商场、餐厅、电信代办、电脑售票、检票、电脑显示船期、票态等配套服务功能齐全。客运大楼参照美兰机场的设计装修标准进行，使之在硬件上达到国内一流水平。
自2023年8月31日20时45分起，在港口车站发班的两广（广东、广西）省际班线、海口港至永兴等乡镇班线（含村村通）车辆全部搬迁至海口省际总站（海口西站）发班运营。