本书分为《海日楼札丛》、《海日楼题跋》两大部分，其中《海日楼札丛》共分为八卷，大致可以分为五个部分，主要内容是作者的读书笔记，重点放在史、地和音训之学。《札丛》的第一部分是经学，主要讲述了鼎革、纳甲主月、夏道遵命、格人、六行、调人、边见等。第二部分讲的是历史和舆地，主要讲述了太史公、余吾水、军自当、大秦国、讹言、乌丸、六朝论治近古、回纥、新李、五卫等。第三部分是哲学、宗教和医学书中关于儒学的阐释内容虽然不多，但是都非常有见地。在佛学方面作者开始考证密宗萌芽在龙树之前等，都是前人在
佛学研究领域中没有触及的问题，关于禅宗的部分，更是有着非常多的创见。《札丛》的最后一部分是书法。《海日楼题跋》共分三卷：第一部分是书籍板本，在这一部分中，作者具有自己的见解，订正前人的误说，探索某些本子的本来面目。第二部分是碑帖，在这一部分中，融会各篇，可以系统地成为沈氏研究碑帖的一家之笔。第三部分是书画真迹，在这一部分中颇见作者对古典艺术的欣赏。本书充分的再现了沈曾植先生的学问的全貌以及传统学术历久弥新的美丽，是广大文化史感爱好者的理想选择。