2009年12月22日正式经
深圳市科技工贸和信息化委员会和
深圳市民政局批准通过，升级更名为“深圳市钟表研究院”。中心主要承接了部分政府转移的职能：
深圳市钟表质量检验中心、深圳市钟表产业集聚基地、深圳市钟表协会培训中心、深圳市钟表技能鉴定所、中国钟表信息平台《深圳钟表》、《时刻》杂志、《深圳钟表》英文版、深圳市钟表知识产权资讯中心、产品创新设计中心、钟表产业预警中心和正在筹建中的钟表标准化中心。
深圳市钟表研究院将通过下属的产品创新设计中心将引进全球最先进的达索PLM系统（目前主要应用在全球的航空工业和汽车工业、通讯产业），建立钟表虚拟产品开发体系，推动钟表行业产品设计标准化，迈向自主或代工产品创意设计，提升整体业界水平。
深圳市钟表研究院的成功升级将给钟表及延伸产业提供更优质的配套服务，将有利于深圳市钟表产业基地总部经济大厦的发展，促进基地内深圳市钟表技术公共服务平台的建立，推动和加快基地建设的进度。