深澳线是由台湾铁路管理局经营的铁路支线，於1989年停止客运业务，仅保留一小段作为深澳电厂煤运专用线。2007年因电厂改建而停用，现因应台湾海洋科技博物馆启用，於2014年1月9日恢复客运。

本地区原有在日本侵占时期已完工，经基隆八尺门、八斗子、深澳至水湳洞(濂洞)的矿业铁路水八线。但由于经营者台湾金属矿业公司财产不佳，无力续营，遂于1962年8月26日全线废止。

台湾“铁路管理局”另自瑞芳车站分歧，新建标准较佳的深澳线；至深澳路线于1965年4月8日开通，并开始办理整车货运。1967年8月25日通车至水南洞(濂洞旧称)并正式通车，办理客货运。

因配合滨海公路兴建，1977年12月1日海滨、濂洞两车站停止营业，翌年1月11日海滨车站恢复。但随着公路完工后的竞争，全线自1989年8月21日裁撤，仅保留至深澳火力电厂的线路以为运煤用。2007年最后一班货运开出后，停驶至今。

2008年“国立”海洋科技博物馆将开馆，相关部门计划本线重新办理客运，倾向整建为轻轨系统，复驶至八斗子车站，并计划往西另行新建至海科馆及碧砂渔港的分支路线，以配合博物馆及附近景点的交通需求。

据台湾《中国时报》2012年11月报道，过去二度停驶的台湾最美铁路“深澳支线”拟将于2013年恢复运营。

“深澳支线”是台湾唯一一条滨海支线铁路，依山傍海的绝美风景深植铁道迷内心，被誉为台湾最美的铁道。过去二度停驶，逐渐被遗忘。直到海洋科技馆即将开幕，为方便预期将爆量的旅客搭乘，馆方与台铁合作，将这条最美铁道的记忆拾回，预计在2013年10月重展迷人风光。

海洋科技馆研规组李瑞源表示，深澳支线已修复，若2013年海科馆如期开馆，台铁将提供四节柴电车厢服务旅客，车厢还会依照海科馆各馆特色彩绘。消息一出，铁道迷早已引颈期待。

2014年1月9日上午十时，台铁资深司机员吴德荣按下启动钮，三节彩绘列车缓缓驶出瑞芳车站，为这条“最美的铁路支线”复驶暖身；中午12时50分，正式“首航”载客，列车串起沿线水与绿的优美风光，也找回铁道人气。“国立”海洋科技博物馆表示，深澳线海科馆站月台9日也举行启用典礼，海科馆站是因海科馆开馆而规划的火车停靠站，是全台唯一设置在博物馆区的月台。

台铁表示，未来将合并深澳与平溪两条支线，游客即可拉长游憩路线，从菁桐一路畅行到海科馆。

瑞芳车站第三月台昨天上午停靠三节绘有海洋主题的彩绘列车，吸引游客驻足合照，当发车的绿灯号志亮起，司机员吴德荣按下启动钮，这条停驶四分之一世纪的支线客运列车再度“复活”。

火车缓缓前进，前方的轨道从多轨逐渐减为单轨（注：实际为单线双轨），这时沿途的风景也跟着改变，列车从水泥丛林转进树林；拐个弯，列车开进隧道，一出隧道就“呜、呜”鸣笛两声，提醒两旁住户列车来了。

据悉，海科馆与台铁合作，以九个展厅做为车厢彩绘主题，分别是海洋渔业号、深海映像号、海洋未来号、儿童探险号、海洋探测号、海洋环境号。为了让旅程充满惊喜，海科馆开发智能型手机“海科号App”，只要把手机对准车厢，屏幕上可看到大海怪爬出车厢、或火车化身潜艇等有趣景象。

游客搭支线列车从瑞芳直达海科馆，只要10分钟。单程4.2公里，全票15元新台币，来回28元，每天开行20列次、可载8500名旅客。民众可下载「海科号」App，透过智慧科技与彩绘列车玩互动游戏。

深澳线主要车站：瑞芳、海科馆、八斗子