在北宋，江南道教本以正一教为主干，在元朝时又与全真教合宗。在武当山则多种派系共存，这是湖北武当道教的特性。

进入南宋时，湖北地区独创的混元派系其所传正法恰是：《混元六天如意大法》。武当山还保留了混元派谱如下：

一永通玄宗　道高本常清　德祥恭敬泰　义久复圆明

混元三教主　天地君亲师　日月星斗真　金木水火土

另白云观所存混元派谱为：

混元乾坤祖　天地日月星　三教诸经师　金木水火土

浑合本空洞　朝谒上玉京　虚无生一气　良久归太清

混元教派人道传承的开宗立派者是南宋时期雷默庵(1221—1295)。根据《道藏》中《历世真仙体道通鉴续篇》第五卷中四四六页记摘录如下：

“真人姓雷，讳时中，字可权，号默庵。其先本豫章人（释：即今江西南昌），后家于今湖广之武昌金牛镇，所居溪水回环，东西二桥，故又号双桥老人。生于宋嘉定辛巳年（公元1221年）十一月十五日辰时。幼习词赋，后通诗经，三领乡荐，精心道学，专务性理。

与九江吉甫亲，因巳未庚申之难，揭家依居吉甫。甲子岁（公元1264年，应43岁）殿帅往太平宫酬醮。师从其行，夜宿太平宫之听雨轩。恍惚间见上帝亲谓语曰：‘卿，阳禄无份，阴官有缘。不须留意功名。’是夕，本宫知宫（释：即是太平宫主持）亦梦采访真君。告曰：‘来日午刻可精严祀事，五百灵官中有一灵官亲降于坛炷香。’次日午朝，殿帅谓师曰：‘我困甚，师可代烧香’。

及至坛中，知宫大骇，方知师五百灵官中人也。后知宫白于师，师愈留心道法，绝念功名。复回居金牛镇，置坛祀事。庚午（公元：1270年，应53岁）三月三日，玄武诞辰，（释：就此可以了解真武的神传在湖北的影响）可师具表贺，焚香朗颂《度人经》，忽有一道人标格异常自外至，谓曰：‘贫道有一阶道法，特来授汝’。因出袖中书一卷曰：‘可置此文于坛中，斋戒七日后方可开看’。师受之置于香案，回首道人已出，不知所在。

方悟其为异人也。（释：可以假借是神仙显象度人）入坛拜谢，持诚斋戒七日，焚香拜礼开看其文，乃‘混元六天如意道法’。（注：据《道藏》中录《道法会元》一百五十四卷，其书目名应是《混元六天妙道一气如意大法》）看毕，坛中白昼如夜，须臾雷火布满，雷霆辛天君立于案上曰：‘吾奉昊天敕命，付卿开阐雷霆之教，普济众生。吾教上帝为主，以吾佐之，以卿行之。前日授卿之文者，乃祖师路真君也。卿名在仙籍，七世为儒，三世行法，并无纤过，当大兴吾教。’

“……所着《心法序要》、《道法直指》、《原道歌》皆发扬混元道化之妙。以至元乙未四月初五日沐浴更衣端坐临午，命卢、李二师率诸门人讽《度人经》一卷毕，即索笔纸书颂曰：‘一轮明月照清穹，万里无云光霁中。自在逍遥无一事，圆融常与太虚同’，颂毕凝然而逝。是年冬，弟子奉葬于郡之颜山后，雷霆累降笔云：上帝已升真人为玄都上相混元妙道普济真君雷神演教天尊。”

由上述的记载可知：雷默庵是在1264年到江西太平宫，得到知宫的点化后回湖北，于公元1270年3月3日，玄武诞辰，雷默庵在先师具表贺，焚香朗颂《度人经》时，得路大安真人传授《混元六天如意道法》一卷后，又感辛天君下坛告知，故而开始传道授法。根据上文可知 ：“以吾佐之”是神传护佑，“以卿行之”是人传奉教。 由此雷默庵在天心派神霄雷法的教理下创立混元教派。

《历世真仙体道通鉴续篇》又载：“又考路祖师当晋时，亲遇太上老君授以此法。而是教专以《度人经》为主，师每化导世人及开度弟子，皆令其精心颂经，各获果报。常论《度人经》旨以开后学，其要在十回度人，非惟十遍可以度人。乃在平日修炼自己以究返还之妙。且须先度祖宗，终得道备，飞升上清。经旨之明，莫越是矣。及儒释二家博采旁求，贯彻混融，归于一致。”

该派的传法思想是：“行法布气度人救人。以炼己返还,培元固本，再行罡布气，治病救人。”在就何谓“混元一气”的论证时，雷祖阐述：“此气是先天祖气，人人有之，特明与不明尔。即佛释所谓本来面目，父母未生前之妙也。含于一而为混，合乎万以归元”。这就是混元教义的本义。该派持教强调：必先尊祖宗，皆是以孝道明法。

按其说法，天地人三才之道无非是阴阳二气的变化规律而矣。故道是宇宙的大一统论、本体论，是宇宙之生存有序性及结构性，故其显者为象，藏者为数，其交者为气，万事万物同在宇宙之大一统规律下，万化不离阴阳之变，不受任何人为的主宰。人同宇宙气运是统一的，人的魂魄，时常游离本体，故常耗损。如果站在现代社会的角度来认识的话，可将其游离之气喻为“能量”，能量是永恒的，是可以互为转化的。这个肉眼看不见，摸不着的规律，即是道的本体。

至于修炼思想，混元派是以道教之混元思想作为宗旨，以元神为主宰进行修炼。在《修炼直指》中，雷默庵很精辟的论断阐述出：“夫修真之事皆是自己本真，非他外物而成者。其修炼亦自然之功，更不劳心费力。且四时代谢，为万物发生。天地何尝用力施工，皆自然而然。

”主张“吾身者魂魄也，日月即天地之魂魄，魂魄即吾身之日月也，先贤所谓日魂月魄是也。日月常交会，天地所以无穷。魂魄常支离人身，所以有尽。”雷默庵阐述到：“故天地之造化不外乎魂魄，日火也，魂亦火也。而心为神舍，神即魂神。心赖肝木相生，则魂神居焉，故曰：‘龙从火里出’。月水也，魄亦水也，而肾为气海，气即魄。气赖肺金相生，则魄气依焉，故曰：‘虎向水中生’。圣人设教，千经万论，莫不教人收心养气。总而言之不过拘制魂魄而已。”

混元教派秉持混天思想体系，将人体头部以喻应天，腹部以喻应地，将人体的任督二脉以感应天地之气。设百会为先天之鼎。（含泥丸）设会阴为先天之炉（含膀胱），又以任脉对应南斗，督脉对应北斗。是应先天之卦，应先天品物流行之气。视祖窍为窗口，百会及会阴为门户。又设肚脐为后天之鼎，膀胱为后天之炉。生门脐是生我之根，命门是死我之蒂。修炼就是要生化，返聚先天真一之气于后天鼎中，以求返还之机。“寂然不动，感而邃通。”

《历世真仙体道通鉴续篇》记载：是年（1270年），“四方闻其道行卓异，及其门者日众。弟子数千人，分东南西蜀两派，首度卢、李二宗师及南康查泰宇。

由是卢、李之道行于西蜀，泰宇之道行乎东南。混元之教大行于世。”道教混元派由此流传下来。混元派继形成为湖北地区的特有教派后，其主坛又遍及湖北的武当山及九宫山。随即盛行四川与东南。

混元派传承，虽然师祖字派为“昌”字，师父字派为“宏”字，上沿字派断脉，依修持方法理论在接嗣中皆完美无缺。凡是禀承混天学说的思想及流派应为“混元派”，这是古人的一种说法。以修炼内丹为主以神霄雷法济世度人为辅是混元教派的修持宗旨及特征。

按此推论，时至今日，这种“混元派”的影响还很大。武当山真武大帝的威仪及神传现在已经远播大陆及港、澳、台两岸四地及其它许多国家和地区。惟愿：

混元再现，真武演正。

随缘入世，德备功成。

弘道传教，济渡众生。

无为自化，世界大同。