湖南省畜牧水产局是人民政府的职能部门，负责研究拟定全省畜牧业、渔业、饲料工业发展战略、中长期发展规划、年度指导性计划，经批准后组织实施。
主要职能
（一）研究拟定全省畜牧业、渔业、饲料工业发展战略、中长期发展规划、年度指导性计划，经批准后组织实施。
（二）研究提出全省畜牧业、渔业、饲料工业发展政策建议，引导产业结构合理调整和资源合理配置；参与研究拟定畜牧业、渔业和饲料工业法规、规章草案。
（三）研究拟定全省畜牧业、渔业产业化发展规划，推进产前、产中、产后一体化；研究提出全省畜牧业、渔业产品加工业发展建议；预测并发布畜牧业、渔业和饲料生产资料、产品供求情况等经济信息，指导行业信息网络建设。
（四）研究拟定全省畜牧业、渔业、饲料科技发展规划；组织重大科研和技术推广；指导畜牧水产技术推广体系建设；拟定地方性畜牧业和渔业种苗、产品、兽药、饲料药物添加剂质量标准和技术标准经批准后监督执行，制定饲料和饲料添加剂质量标准和技术标准。
（五）负责全省种畜禽、水产种苗、牧草种子、兽药、兽医医疗器械、饲料药物添加剂的质量监测、鉴定和执法监督管理。
（六）负责地方畜禽、水产品种资源保护与开发利用，负责畜产资源、草地资源保护、开发利用和监督管理。
（七）责全省渔业行政执法监督管理，保护渔业资源；负责渔船检验和渔船渔港安全监督管理；负责渔业水域生态环境及水生野生动植物保护。
（八）按照有关规定，负责全省兽医医政、兽药药政药检工作，承担动物及动物产品检疫和动物防疫及其监督、监测、预报、发布动物疫情，组织实施动物疫病的控制与扑灭。
（九）按照权限管理畜牧业、渔业专项资金，提出专项资金安排计划，组织畜牧业和渔业重大项目的申报、审核。
（十）承办省委、省人民政府和省农业厅交办的其他事项。
内设机构
办公室 计划财务处 科技教育处 畜牧处 渔业处 质量安全处
渔政渔港监督管理处 饲草业处 机关党委（人事处） 纪检监察室 后勤服务中心
省畜牧水产局直属机构
省兽医局 省动物卫生监督所 省动物疫病预防控制中心
省饲料工业办公室 省畜牧兽医研究所（省家畜育种工作站） 省水产科学研究所
省兽药饲料监察所（省畜禽水产品质量检验检测中心） 省畜牧水产技术推广站（省水生动物防疫检疫站）
湖南张家界大鲵国家级自然保护区管理处