潍坊出口加工区于2003年12月经国务院批准设立，总规划面积3平方公里，分两期建设，一期围网1.7平方公里。同时，潍坊市委、市政府在围网南侧批准规划了3.8平方公里的产业及生活商务配套区。2005年8月一期通过国家九部委联合验收，并正式封关运行。2006年4月，市委、市政府为加快出口加工区的发展，促进机制体制创新，单独设立潍坊出口加工区党工委、管委会，内设“一办三局”，即党政办公室、经济发展局、财政局、建设规划局。视同一级财政管理单位，享受市级经济管理权限，实行“特区特管”政策。按照国家设置出口加工区的要求，海关、国检、工商、税务、国土等部门已驻区办公，为项目入区建设和经营提供“一站式”服务。 潍坊出口加工区位于潍坊市区东部济青高速公路15号口南侧，北靠309国道，南邻胶济电气化铁路，东有潍莱高速公路；距青岛、济南两个国际机场分别为120公里和180公里，距潍坊机场10公里；距青岛港和潍坊港分别为150公里和50公里；距潍坊火车站5公里，交通十分便捷，区位优势明显。

潍坊出口加工区是一个实行优惠贸易政策、由海关监管的特殊经济区域，是开放层次最高、政策最优惠、运作机制最灵活的经济开放先导区。。即开展加工贸易业务不实行加工贸易银行保证金台帐制度；海关不实行《登记手册》管理等。伴随着对外贸易经济的发展,只有保税加工单一功能的出口加工区,在项目进区中受到局限。为加快出口加工区的发展,国家拟将出口加工区、保税区等六种海关监管特殊区域转型命名为综合保税区, 配置统一的功能和优惠政策,执行统一的管理制度和监管模式。整合后的综合保税区具有保税加工、保税物流、货物贸易、服务贸易等四大功能,在产业、税收、贸易等方面有着更加优惠政策,这将加快出口加工区的发展，对提高我市经济外向度发挥重要作用。目前，拓展保税物流功能已经展开，正在研究有关政策，开展保税物流业务。出口加工区重点发展电子信息、生物医药、精密机械制造、机电一体化和农副产品深加工等产业。主要引进投资规模大、产业链条长、辐射带动力强、科技含量和附加值高、无污染、低能耗，建筑容积率控制在1.2以上的大项目。目前，入区项目14个，其中竣工投产项目三个，分别是：日科塑胶项目、雷力发电设备项目、印尼锆英沙精加工项目。

潍坊出口加工区具有优越的投资环境。园区内建成了标准厂房15万平方米，利用赋予的国家政策，正在吸引潍坊及周边地区短平快项目入区，企业注册后便可入区经营。建成一栋1.7万平方米可容纳2500多人的职工公寓，并将入区企业职工生活纳入统一管理，减少了企业经营成本，让企业一心一意搞生产；3万平方米二期职工公寓已开工建设，建成后可容纳3000名职工食宿，今年下半年投入使用；开工建设了3万平方米的白领公寓和综合商务楼，今年年底前投入使用，将企业高层管理人员纳入统一管理，并为企业提供集商务、金融、生活等于一体的综合性服务。同时，为吸取国内先进出口加工区园区绿化的经验作法，将环境立区融入规划之中，实现人文、自然、产业的有机结合，对园区和监管区进行了高起点绿化，努力打造一流的绿化环境。

潍坊出口加工区于2011年1月25日获得了国务院的批复升级为潍坊综合保税区，成为山东首个、全国第十四个综合保税区。潍坊综合保税区封关验收后，不再保留潍坊出口加工区。