潜邱学派博通经传，精于舆地之学，尤以考据名闻于世。
阎若璩年二十读《尚书》，至古文二十五篇。即疑其伪，盾沉潜三十余年，乃尽得其症结所在，作《
尚书古文疏证》八卷，引经据典，一一指出其矛盾之处。从而确证东晋梅赜所献《古文尚书》为伪。毛奇龄撰《古文尚书冤词》，力辩《古文尚书》为真，终不能推翻其说。若璩又撰《四书释地》。于人名、物类、训诂、典制等，旁参互证，多所贯通。若璩弟子万经也长于经学。
潜邱学派的治学态度、治学方法及其成就，影响颇大，赵执情为
阎若璩撰《墓志铭》赞曰：“先生非今之人，盖古之学者也。其于书无所不读，又皆精晰而默识之。其笃嗜若当盛暑者之慕清凉也；其细密若织纫者之丝缕纤编也；其区别若老农之辨黍稷葱粟也；其用力，虽壮夫骏马日驰数百里不足以喻其勤；其持论，虽法吏引因决狱，具两造、当五刑不足以喻其严也。”
近人梁启超在《中国近三百年学术史》中指出：“百诗为什么能有这种成绩呢？因为他的研究方法实有过人处。他的儿子说道：‘府君读书，每于无字句处精思独得，而辩才锋颖，证强出入无方，当之者辄失据。常曰，读书不寻源头，虽得之殊可危。手一书至，检数十书相证，侍侧者头目为眩，而府君精神涌溢，眼烂如电，一义未析，反复穷思，饥不食，渴不饮，寒不衣，热不扇，必得其解而后止。’他自己亦说：‘古人之事，应无不可考者，纵无正文，亦隐在书缝中。要须细心人一搜出耳。’戴东原亦说：‘阎百诗善读书，百诗读一句书，能识其正面背面。’大抵百诗学风，如老吏断狱，眼光极尖锐，手段极严辣，然而判断必凭证据，往往在别人不注意处得来。《四库提要》赞美他说：‘考证之学，未之或先。’百诗在清学界位置之高，以此。”
对于
阎若璩考证《古文尚书》之伪的影响，梁启超评价说：“请问区区二十篇书的真伪，虽辨明有何关系，值得如此张皇推许吗？答道，是大不然。这二十几篇书和别的书不同，二千余年来公认为神圣不可侵犯之宝典，上自皇帝经筵进讲，下至蒙馆课读，没有一天不背诵他，忽焉真赃实证，发现出全部是假造，你想，思想界该受如何的震动呢？”
一些学者在肯定其考证方面的成绩的同时，对于其他方面则评价不高，
全祖望说：“阎徵君所著书，最得意者，《
古文尚书疏证》也，其次则《四书释地》。徵君稽古甚勤，何义门学士推之，然未能洗去学究气，为何？借使人不能无陋儒之叹。”