灰霉菌（Botrytis cinerea），又称灰葡萄孢菌，是一种广寄主性的、能够引起多种植物幼苗、果实及储藏器官的猝倒、落叶、花腐、烂果及烂窖。潮湿时病部表层产生大量的灰色霉层（分生孢子梗和分生孢子），称为灰霉病。其在空气中广泛分布，不仅能够侵染田间作物，同样会给植物的采后阶段造成巨大损失。日常生活中遇到的果蔬放一段时间会长毛，多数就可能是受到了灰霉菌的侵染。截止2013年，世界上尚未发现有任何一种植物对灰霉菌产生抗性。

灰霉菌子实体从菌丝或者菌核生出；分生孢子梗280~550*12~24微米，丛生，灰色，后转为褐色，其顶端膨大或是尖削，在其上有小的突起；分生孢子单生于小突起之上；分生孢子亚球形或卵形，9~15*6.5~10微米。

灰霉菌是葡萄孢属中的一个最大的类群，由于真菌种级划分标准一直没有统一的尺度，如能进行PCR检测，则有可能区分出不同种或种下单位，或归为不同型种。灰霉菌作为一个复合种，种内不同菌株之间在生物学特性、致病性和抗药性上均存在较大差异。

灰霉菌能够在低温条件下(0℃)生长，靠产生大量的灰色分生孢子进行传播，与其它采后病原真菌相比，具有潜伏侵染和低温致病的优势。同时，其还具有繁殖快、遗传变异大和适合度高的特点。

灰霉菌以菌核、分生孢子及菌丝体随病残组织在土壤中越冬。有些地方，灰霉菌秋天在枝蔓或浆果上形成菌核越冬，也可以菌丝体在树皮和冬眠芽上越冬，其抗逆性强。翌年春季温度回升、遇雨或湿度大时从菌核上萌发产生分生孢子，或是其他寄主上的分生孢子借气流传播到花穗上。分生孢子在清水中几乎不萌发，在花器上有外渗物刺激时很容易萌发侵染，通过伤口、自然孔口及幼嫩组织侵入寄主，实现初次侵染。发病后又可产生大量分生孢子，借风雨传播蔓延进行多次再侵染，引起灰霉病。

灰霉病最初只是流行于欧洲和美洲，自20世纪80年代才开始在中国发生蔓延。由于温室和大棚种植技术的推广普及，作物灰霉病害严重，已成为蔬菜、花卉和林业苗培育基地生产的主要限制因素。

2013年10月4日，美国加州大学河滨分校金海翎等人在出版的美国《科学》杂志上报告说，灰霉菌除了会输送特殊蛋白质进入植物细胞内部，以抑制植物免疫防卫机制，从而达到有效侵染的效果外，还会利用一种叫做小分子RNA的分子进入植物细胞内部，从而抑制植物免疫系统，这也是首次发现有病原菌利用小分子RNA来达到有效侵染的效果。同时，研究人员怀疑，除了灰霉菌外，其他侵染力比较强的真菌同样拥有这种利用小分子RNA的侵染机制。他们表示，这一研究不仅发现了新的致病机理，而且很有可能打开了一个新的研究方向。