灵鹫岩位于德化县西北部九仙山中，始建唐开元四年（716）。 唐初，福建沙县梅列邹无比在九仙山牧牛，种菜，长期修行说法，后坐化成佛。开元四年（716），信徒为其塑像崇拜，奉为“邹公祖师”，并以石柱石梁建灵鹫岩奉祀。

灵鹫岩寺的墙、柱均为石筑，释迦牟尼等15尊佛像亦为石雕。明代万历年间柱础重修，新建山门石坊。德化知县杨文正“一方净土”题匾和永春知县厦忠“胜迹维

新”题匾高悬于坊上。大学士张瑞图、太仆卿丁启睿、状元学士庄际昌、进士户部主事郑沛、邑司训甘天训的题刻牌匾悬挂于主殿两侧。清初整修两殿，增置岩田。

该寺在明清时代一度成为本省尤其是闽南一带佛教活动的中心之一。据清乾隆版《九仙临峰谱》载：明弘治年间（1488—1504）由福州鼓山（禅宗派）密宗第四徒僧道盛（号一斋）来德化主持大白岩，授徒18人，万历年间往九仙山灵鹫岩，自成九仙派系。其僧徒发展至900多人，分成18个支系，陆续到尤溪、大田、永春、同安、漳州、泉州、沙县等地弘法，分住或住持全省89处寺庙。 九仙山灵鹫岩寺历经沧桑，文化革命期间被毁。1988年初，原灵鹫岩住持、现美国美洲佛教会永远顾问兼副会长释宽净法师倡议重建，得到美国蒙特利公园市般岩修德善堂华裔信众资助，历经两年，该寺大雄宝殿、观音殿、禅房、钟鼓楼、外山门等先后落成。

全国佛教协会会长赵朴初亲笔题写寺匾。1990年11月3日举行重建落成暨开光典礼。

1990年2月17日，泉州市人民政府批准该寺对外开放作为佛教活动场所。1990年11月3日举行重建落成暨开光典礼。　重建的灵鹫岩基本保持原来的规模，保留着古迹，而且增加了许多龙，凤，狮及各种花卉，飞鸟的雕刻。还从缅甸恭请来玉佛三尊、从泰国恭请来金铜佛三尊。

三尊缅甸玉佛，是缅甸北部瓦城名艺人用汉白玉精雕细刻而成的。其中释迦牟尼佛像高1.93米，底座宽1.30米；药师佛像高1.80米，底座宽1.15米；阿弥陀佛像高1.80米，底座宽1.30米；每尊约重2吨。

三尊泰国金铜佛，其中有金铜如来佛1尊，鎏金四面佛2尊。金铜如来佛头顶螺壳发出亮光，两耳垂肩，两脚盘坐莲台，右手当胸，左手平放腿部，具有泰国风格。四面佛又名大梵天王，有4个面庞，8双耳朵，8条手臂。4个脸象征慈悲、仁爱、博爱、公正，佛教称之为婆罗门4法；8条手执着8件法器：书本代表智慧，念珠代表轮回，枪棍代表至上成就，花瓶代表解渴、有求必应，螺壳代表赐福，按胸手印代表庇护，飞轮代表消灾降魔、摧毁烦恼，如意宝代表万能法力。寺的附近有弥勒洞，内有弥勒石佛，高2.7米，宽3米，周长8.9米。另有“甘泉”、“说法台”、“回照池”等胜境。