灌云县东北部的云台山南麓有一条清水河，相传自唐朝以来，历朝历代都有无数香客来云台山朝佛敬香，他们均经过这条河坐船一直到云台山下，香客们在上船后即烧香膜拜，以示虔诚，故名此河为“烧香河”。
烧香河流域西起盐河黑风口，东行经南城闸，再东至东辛农场五分场西侧，主河道东流至小岛河口分岔，一支经小板跳，穿驳盐河到大板跳的烧香河北闸入海；另一支折弯南下，经海堤河到东陬山西山嘴的烧香河南闸，出埒子口入海。全长46公里，流域面积427平方公里。
烧香河主体部分西盐河口至烧香河北闸，全长31公里，河口宽度40至60米，堤防管理范围为左右堤各60至80米；南支上起烧香河板桥段下至烧香河南闸，全长19.1公里，河口宽度60至70米。