日本的特别区只设于东京都的中心部分，共有23个，如千代田区、中央区、文京区、新宿区、台东区、港区、涩谷区、世田谷区、品川区、杉并区等。特别区从1947年开始设立，是“特别地方公共团体”，即不享有完全的自治权。特别区与市町村共同组成了日本的二级行政单位。

尽管它们的人口多超过核心市甚至已经接近于政令指定市，但它们的行政首长即区长却曾经长期（1952~1975 ）由东京都知事任命。近年来，要求扩大特别区的自治权甚至要求将其改为“普通地方公共团体”的呼声日益增高。

千代田区（ちよだ く）是东京都内23个特别区之一，包括日本天皇的住所——皇居、日本国会（永田町）、最高裁判所（最高法院）、靖国神社与大部分设置在大手町的中央省厅（中央行政单位）等等，全都位于千代田区内，因此该区可说是日本的政治、经济中心。除了政治中枢的机能外，日本诸多著名公司的本社也设在该区，而闻名海外的电器街秋叶原也在千代田区。

中央区（ちゅうおうく）是日本东京都内的23个特别区之一，由于其位于23区的正中央位置之故，因而得名。

中央区不仅地理位置处于东京的中心地，更是日本经济、信息、商业等的中心。著名的日本银行、东京证券交易所等日本经济核心都位于中央区，除此之外，包括银座，大型布庄与百货公司总社聚集的日本桥，以及以鱼货市场出名的筑地皆位于本区范围之内。

港区（みなと く）是日本东京都内23个特别区之一，是一个聚集着诸多外国大使馆、国际气氛浓厚的地区。

港区位于东京东南方、紧邻东京湾。境内较著名的市街包括有赤坂、经济活动活跃的新桥・滨松町等商务街、外国观光客与酒吧云集的六本木、高级商店街的青山、新兴的游乐观光区台场、以及自2002年以来逐步开发完成的两个大型复合都市地带—“六本木Hills（ヒルズ）”和“汐留Sio-site（シオサイト）”。

日本第一高也是东京最重要地标之一的东京铁塔就位于此区内。

新宿区（しんじゅく く）是日本东京都内23个特别区之一，也是东京乃至于整个日本最著名的繁华商业区。东京都厅（都政府）位于新宿区内，是整个东京都的行政中枢。

新宿区位在东京市区内中央偏西的地带，区内的新宿车站是东京市区西侧最重要的交通要冲之一，包括JR山手线、JR中央本线、JR总武线与私人铁路公司京王电铁、小田急电铁的总部都位在新宿车站，周围还有数条地下铁路线行经。以新宿车站为中心，以西的西新宿是东京政府新规划的行政与商业新都心，东京都的行政中心东京都厅就位在此处，除此之外周遭还包围了许多大型企业总社所使用的摩天大楼，此超高层建筑群是东京地区最早形成的类似区域。东京车站南口方向则是百货公司与商店街云集的商业地区，其中最著名的包括有高岛屋百货公司的旗舰店“高岛屋时代广场”（Takashimaya Times Square）与知名日本连锁书店纪伊国屋的总社.相对于西新宿的现代化与整齐，新宿车站以东的东新宿地区，则是最热闹也是最混乱的传统商业街地区，其中，闻名海外的红灯区——歌舞伎町（かぶきちょう），就是位在新宿区之内。

在非常受欢迎的日本漫画城市猎人中，就是以新宿车站东口公园作为最主要的舞台。

文京区（日文：ぶんきょうく、 Bunkyoku ）几乎位于东京23区之中央。该区集中了日本不少的国私立大、中、高等学校，因而得有文化教育区之美名，日本最高学府—东京大学的本部校区（本乡总校区）即在本区。另外还有1990年落成的“东京巨蛋（东京ドーム）”超大型室内棒球场、这个棒球场内有的“野球体育博物馆”作为日本的棒球名人堂被知道。旁边的小石川后乐园为东京著名的庭园地之一，附近还有2003年改建完成的大型游乐地带“LaQua”。

台东区（たいとう，Taitou）拥有上野，浅草两大繁华商业街的台东区自江户时期以来以聚集商工业者为主的居住区而闻名。该区域的特产是皮革制品、人偶、玩具、传统工艺品等

墨田区（すみだ く）是日本东京都内23个特别区之一。其特点是一个夹于河川之间的城区。西边以隅田川为区的区境，而荒川及中川合致而成为东边的区境。

江东区（こうとう く）是一个位于东京都东部、面临东京湾、夹于隅田川与荒川之间的城区。由于该城区内运河与桥梁众多，亦被称作为“水彩都市”。

品川区（しながわ、Shinagawa）西望富士山，东凭东京湾，是东京的海关区。2003年建设而成的JR东海道新干线品川新站，使得品川成了东京圈铁路交通网络的核心（另外两个是东京车站和北侧的上野）。品川站东侧出口周围的大型复合都市地带也随之开发完成。

目黑区（めぐろ く）是东京都下辖的特别区其中之一。

大田区（おおたく）是东京23区之一。境内有东京国际机场（羽田机场）。

世田谷区（せたがやく）是一个位于东京都23区的南西部、通往都心部方便、以居住环境良好的住宅区而闻名的东京都特别行政区。

涩谷区（しぶやく渋谷区）是东京都特别行政区之一。涩谷区是东京一个富有个性的行政区。其不仅是东急集团公司的中心地，而且所有商业活动兴旺，这尤其体现在涩谷车站忠犬八公出口处，著名的百货店、时装专卖店、饮食店、咖啡店、游技设施、风俗设施等密集如云，是与新宿同样被列为“24小时不眠之街”的城区。另外，自前所拥有的“年轻人之街”之美称，使得涩谷成为面向日本国内外各种流行的发信地。

中野区（なかの く）是日本人口密度最高的底层住宅区域。区内产业主要以第三产业的服务业为中心，而事业所及从业人员个数则处于东京23区的中下位。

杉并区（すぎなみ）是日本东京一个自然环境丰富的住宅型区域。关东大地震之后多数的文化人、学者移住该区。近年来作为日本动画产业的集中地而引起注目。

丰岛区（としま く）是东京都内23个特别区之一，位在以往东京市的区域内西北角一带。其命名由来源自日本废藩置县之前，武藏国丰岛郡的古名，当东京市在进行行政区域扩大时，四个原属北丰岛郡的町被合并划入东京市的范围之内，而赋予丰岛区的命名.丰岛区是一个人口密度高，且集时尚与传统、年轻与老年于一体、富有个性的区域。境内最重要的市街为池袋车站为中心的商业区，除此之外，驹込、巣鸭、大冢、目白等地区都是丰岛区境内比较知名的市街，东京市区内最重要的铁路路线JR山手线在这几个地区都设有车站。曾经是东京都内第一高楼的太阳城大楼（サンシャインシティ）就位在区内的池袋地区。

北区（きた く）是一个位于东京都区部的北部、东西约3km、南北约9km、东京都特别区的其中一区。

荒川区（あらかわく）是一个位于东京都的北东部、东西细长、北部区境与隅田川相吻合的东京都特别行政区之中的一个行政区。 江户时代的荒川区是一片农田。明治时代开始，人们利用荒川的水源建设了众多的工厂，从而推进了工业化的发展。 1932年，据于东京都35区制的实施成为荒川区。

板桥区（いたばし く）是位于东京23区北西部、东京都特别行政区之一。

该区域是关东平野的一部分。北面由荒川、北西由白子川而与埼玉县相接。靠近荒川的北部地区，新河岸川由东向西而流，而南部的石神井川则是由西向东横切。除了住宅地・商业地以外，区的北部工厂诸多，而住宅地则几乎是高级公寓。

练马区（ねりま く）位于东京23区的北西部。是东京23区中最新制定的一个区，人口约有68万。练马区以拥有众多的漫画家而闻名。闻名的游乐地丰岛园就在该区。

足立区（あだち く）是东京都特别行政区之一。足立区位于东京都的北部，是由夹于隅田川与荒川之间的部分、及占有足立区大半面积的荒川以北部分而组成。拥有代表足立区的繁华街、北千住车站周围的千住地区，在江户时期曾是日光街道的驿站。

葛饰区（かつしか く）是一个被江户川、荒川围绕着的水乡。位于葛饰区金町内的水元公园是东京都内的水乡公园。而位于柴又的柴又帝释天则因电影“寅次郎的故事”（日语:男はつらいよ）的外景地而闻名日本。 另一个有名的地点是秋本治的漫画作品“乌龙派出所”（日语:こちら葛饰区亀有公园前派出所）所在舞台的龟有公园（公园前并没有派出所）。

江户川区（えどがわく）位于东京23区最东面，是东京都特别行政区之一。 江户川区的区名，是源于位于区的东侧南北而流的江户川而来。 江户川区的总面积约为49.86平方千米，其面积之大是东京23区中的第4位。