王祖源（1822—1886），原名伯濂，字莲塘，山东福山人。山西巡抚王兆琛子。

道光二年生于一个士宦家庭。其父王兆琛，嘉庆二十二年进士，授编修，官至山西巡抚，有政绩。道光二十九年为御史杨如奏参，褫职戍新疆，籍没家产，咸丰二年卒。祖源一直随父任，至道光二十一年归里应试，道光二十九年拔贡，任兵部主事。由于其父被参，家产籍没，又加所任为闲官，所以在京十余年间，生活一直非常贫困，清苦甚于寒素，但他持躬俭约，乐道安贫。在京都侯选知府时，其子王懿荣时为户部额外主事，”京秩清苦，父子尝易衣而出，然性耽金石古玩，日流连于厂肆中，量力购置，虽箪瓢屡空弗恤也”。同治十一年改官知府，选授四川龙安知府，龙安是四川府道中第一瘠缺，祖源历任八年，安之若素。光绪五年调任成都知府，不久又升授龙绵成茂道兵备道，官至四川按察司使，光绪十二年以觐见卒于京师。