琼崖抗日根据地是抗日战争时期，海南岛民众在中共红军冯白驹的带领下，由琼（山）文（昌）发展到全岛，所形成的抗日根据地。根据地军民对日、伪军实施反攻，解放了全岛三分之二的土地，在6年多的艰苦斗争中，共作战2000余次，击毙日、伪军3500余人，坚持到抗战胜利，完成了保岛卫民的历史使命。

琼崖即海南岛，位于广东省西南部南海中，其北部平原，中部和东南部均为山地。土地肥沃，物产丰富。海南岛的形势尤为重要，它位置在南海之中，为通往越南、马来、荷属婆罗洲及菲律宾之要道。1939年2月敌侵佔海南岛后，即积极加以开发，作为南侵的跳板。

在国共合作的第一次国内革命战争时期，党就在琼崖地区组织了农民协会，开展革命斗争。1927年4月15日，广东军阀追随蒋介石，发动了反革命政变，屠杀共产党和革命人民。在中共琼崖地委的领导下，5月1日，冯白驹在琼山县领导农民协会开始进行武装斗争，并成立了琼山县人民革命军；岛上东北部各县，也先后组织了农民武装，反抗国民党的统治。“八七会议”以后，琼崖特委统一了全岛的工农武装，成立了中国工农红军琼崖总指挥部，并成立了琼崖苏维埃政府，实行了土地革命，建立了农村革命根据地。红军最多时发展到一万多人。由于强大敌人的不断“围剿”，加上左倾冒险主义的影响，红军和根据地遭到严重摧残，在琼崖特委书记冯白驹的领导下，继续坚持了革命斗争，1936年春，又重新建立了琼崖工农红军游击司令部。此即琼崖革命根据地，琼崖抗日根据地的前身。

1938年10月，日军侵占广州，迅速攻占华南多地。12月，中共琼崖特委与国民党当局达成协议，将冯白驹领导的海南红军游击队改编为民众抗日自卫团独立总队。1939年2月，日军侵占海南。5月，在琼（山）文（昌）地区建立了抗日游击根据地。

1939年5月，广东省第十四统率区民众抗日自卫团独立队扩编为独立总队，并首先建立了琼（山）文（昌）游击根据地。

1940年起，先后成立了东路办事处和西路办事处。在此基础上，1941年又成立了琼崖东北区抗日民主政府。冯白驹任政府主席。

1941年以后，日军连续对根据地发动大规模进攻。经过两年艰苦的反“扫荡”、反“蚕食”斗争，独立总队不但巩固了原有的根据地，还扩大了六连岭根据地，开辟了六芹山根据地。

1943年夏，海南岛黎族、苗族人民举行武装起义，遭到国民党军队血腥镇压。同年底，独立总队选派干部到白沙领导黎、苗族人民的斗争，为创建五指山根据地奠定了基础。

1944年春，琼崖根据地也得到了进一步巩固，琼崖东北区抗日民主政府改为抗日民主公署，下属的琼山、文昌、定安、乐会、万宁、琼东、临高、澄迈等8个县都建立了县、区、乡民主政权。

1944年秋，独立总队改编为琼崖纵队。不久，琼崖纵队领导机关进驻白沙县阜龙乡，进一步领导五指山中心根据地的开辟工作。至1945年7月，控制了白沙境内大部地区。8月上旬，正式成立了白沙县抗日民主政府，在此基础上，琼崖临时人民民主政府也宣告成立，冯白驹担任临时人民民主政府主席。至此，以五指山为中心的琼崖抗日根据地完全形成。

1945年7、8月，根据地军民对日、伪军实施反攻，攻克感恩、儋县等县城，解放全岛三分之二的土地，100多座城镇，100多万人口。根据地从最初的仅限于东北部的琼（山）文（昌）区和澄迈地区，扩大到全岛的16个县境。琼崖纵队从半年前改编时的300人发展到7700余人，在6年多的艰苦斗争中，共作战2000余次，击毙日、伪军3500余人，坚持到抗战胜利，完成了保岛卫民的历史使命。