甘泉学派的一个重要特点，就是力图将本学派与孔孟、宋代理学诸派联系在一起。如湛甘泉认为：“白沙（陈献章）先生之学，追濂、洛、关、闽之轨，以入孔、孟、禹、汤、文、武、舜、尧之大道”（《庐陵黄氏总谱序》），“孔门所谓‘中庸’，即吾之所谓‘天理’”（《庐陵章》）。把自己的“心学”学说从陈献章一直上追至孔子、孟子。湛甘泉弟子洪垣认为：“尧、舜开心学之源，曰‘人心’‘道心’。夫子曰：‘其心三月不违仁。’谓仁与良知、天理，非心不可。然心者，实天理良知之管摄也。”（《答徐存斋阁老》）他把“天理”和“良知”收归于“心”，并且同视为孔子的“仁学”。湛甘泉二传弟子许孚远则说：“孔子之学，自虞廷‘精一执中’而来，其大旨在为仁”，为仁在“克己”，“非礼勿视、听、言、动，此孔门学脉也”（《原学》），这里的“克己为仁”，也就是湛甘泉弟子、其师唐枢所谓的“讨真心”。以后冯从吾又从义理之性、气质之性、理等方面进行儒佛之辨，也有这一层含义。
甘泉学派的规模一度颇为壮观，从学弟子甚众，“相从士三千九百余”（
罗洪先《湛甘泉墓表》）。该派的主要代表人物，从一传弟子吕怀、何迁、洪垣、唐枢等开始分化，二传有名者为许孚远，三传有冯从吾，以后逐渐与阳明学派合流。另外，明末著名心学家刘宗周，经唐枢至许孚远，亦可谓是湛甘泉的三传弟子，其思想也颇受湛甘泉的影响。