甘肃省疾病预防控制中心（
甘肃省预防医学科学院）成立于2001年8月，是由原省卫生防疫站、省劳动卫生职业病防治研究所、省结核病防治所、省地方病防治研究所和省放射卫生防护监督检测所5个疾病预防控制机构归并重组而成。
中心编制443人，现有在职职工401人，其中高级职称人员71人，正高18人，中级职称112人，硕士研究生38人，大学本科176人；中心有2人为卫生部咨询委员会专家，1人被确定为甘肃省“333科技人才工程”第一、二层次人选，3人被确定为甘肃省“555创新人才工程”第二层次人选，5人被评为甘肃省医疗卫生中青年学术技术带头人。
中心现有鼠疫、
碘缺乏病、
大骨节病、结核病、病毒病防治、免疫规划、艾滋病确认、放射核素监测、食品检测与安全9个学科被省卫生厅评为“甘肃省预防医学重点学科”。
中心主要承担着全省传染病、地方病、职业病、
慢性非传染性疾病的预防控制；突发公共卫生事件应急处理；食品卫生、学校卫生、职业卫生、放射卫生、公共场所卫生监测；健康相关产品卫生检测检验；健康教育及部分疾病的治疗以及疾病预防控制科学研究和疾病预防控制人员的培训工作。2007年，包括食品、化妆品、生活饮用水与涉水产品、消毒产品和环境卫生、职业卫生、放射卫生以及疾病预防控制等方面共4大类471项检验检测项目通过国家认监委的认证。中心是兰州大学、
西北师范大学、
甘肃农业大学的实践教学基地和学生就业实训基地。
中心自2001年成立以来，至2008年底，有47项科研课题通过省科技厅组织的鉴定，达到国内领先或先进水平，有34项课题分获甘肃省科学技术进步二、三等奖及甘肃省医学科技进步二、三等奖。有495篇科技论文在省级以上专业杂志上发表。
中心多次受到上级部门的表彰：2003年中心被中组部、卫生部等多部门授予抗击非典先进集体称号；2004年中心被人事部、卫生部、
国家中医药管理局联合授予全国卫生系统先进集体称号；2007年中心被省政府授予防治艾滋病工作先进集体称号；2008年中心被卫生部授予抗震救灾先进集体称号。